1123S08033-生物信息学-2023版人才培养方案课程教学大纲.docxVIP

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附件5-1

ADDINCNKISM.UserStyle《生物信息学》课程教学大纲

（理论课程·2023版）

一、课程基本信息

课程号

1123S08033

开课单位

化学与材料科学学院

课程名称

（中文）生物信息学

（英文）Bioinformatics

课程性质

选修

考核类型

考试

课程学分

2

课程学时

51

课程类别

专业拓展课

先修课程

《生物化学》、《分子生物学》

适用专业（类）

化学生物学

二、课程描述及目标

（一）课程简介

将信息技术深度应用于生物学领域，大大加速并深化了生物学数据的获取、加工、储存、分析的效率和理解，从而使生物信息学上升为生物学研究的核心领域之一。生物信息学已经引起了生命科学研究方式、方法的巨大变革。本该课程的目标是面向化学生物学专业学生介绍生物信息学的基本概念、生物学研究中常用信息技术的概念、原理及部分基本技术，以为相关专业课程的进一步学习与科学研究奠定基础。

（二）教学目标

通过本课程的学习，学生将掌握生物信息学的基本概念和基本原理，熟练应用生物信息相关数据库和相关软件。

主要目标如下：

课程目标1：掌握生物信息学的基本概念、基本原理；

课程目标2：了解常用核酸、蛋白生物学数据库内容及其分析方法；

课程目标3：了解组学的基本概念和方法；

课程目标4：常用生物信息学工具软件的使用。

三、课程目标对毕业要求的支撑关系

毕业要求指标点

课程目标

权重

培养目标1：可以继续攻读化学生物学、分析化学、有机化学、物理化学及相关学科的硕士学位；

课程目标1

30

培养目标2：德才兼备、综合素质高、创新能力强、国际视野广的化学专业人才。

课程目标2、3

40

培养目标3：毕业5年后，学生能够胜任科研部门、高等院校或企业的化学生物学、分析、新药研发、应用和管理岗位。

课程目标1、4

30

四、教学方式与方法

生物信息学注意体现学生为主体、教师为主导的讨论式教学，多采用启发式、讨论式的教学方法，激发学生的学习积极性。主要使用多媒体，采取讲授和讨论相结合方式进行教学。

充分利用现代教育技术多媒体手段进行教学，理论联系实际，让学生通过实验更好的理解书本的知识。

五、教学重点与难点

（一）教学重点

有关生物信息学的基本概念、基本原理。

（二）教学难点

有关基本生物信息学的操作的基本原理。

六、教学内容、基本要求与学时分配

序号

教学内容

基本要求

学时

教学

方式

对应课程目标

1

第1章生物信息学的概念和发展历史

了解生物信息学的定义，学科发展历程，主要研究领域，主要内容和方法。

2

讲授

课程目标1

2

第2章生物信息学数据库及其检索

了解数据库的分类以及各级数据库的特征和优缺点；理解核酸及相关数据库的特点及其应用；理解蛋白质及相关数据库的特点及应用；熟练掌握NCBI/EMBL/DDBJ/SWISS-PROT等常见数据库的使用。

4

讲授

课程目标3

3

第3章序列比对原理

了解序列比对的基本概念、常见算法；掌握全局对、局部比对的常用软件操作方法及结果的评估。

4

讲授、演示

课程目标2

4

第4章蛋白质结构预测与分析

学习从蛋白质结构的组织层次、结构测定及预测、蛋白质折叠等方面对蛋白质结构进行分析。

4

讲授与课堂讨论

课程目标1、2

5

第5章基因组学

了解基因组学的基本概念及基因组注释的内容以及常用方法

4

讲授

课程目标3、4

6

第6章转录组学

转录组学基本概念及转录组分析基本流程

4

讲授

课程目标3

7

第7章非编码RNA

非编码RNA的种类、特征、数据库与分析

2

讲授

课程目标3

8

第8章蛋白质组学

了解如何利用生物信息学方法与理论进行蛋白质的表达、翻译后修饰、定位及蛋白质的相互作用，蛋白组研究的主要方法。

4

讲授

课程目标2、3

9

第9章系统生物学

了解系统生物学含义，理解系统生物学的工作框架，了解系统生物学的基本研究方法。

3

讲授

课程目标1

10

第10章合成生物学

合成生物学基本概念及经典案例

3

讲授

课程目标3

11

第11章分子进化与系统发育

了解系统发育分析的原理和应用以及常用软件和数据库的使用。

4

讲授与演示

课程目标4

12

第12章统计学习推理

了解生物信息学中统计学习的基本概念

3

讲授

课程目标4

13

第13章生物信息学的生物学及计算机基础

掌握生物信息学所需的生物学知识，理解这些生物学知识在生物信息学中的重要性；掌握利用数据库资源进行数据检索和查询。

6

讲授

课程目标4

14

第14章第二代测序技术及其应用

学习NGS测序技术的主要平台及其基本原理，了解二代测序数据的分析流程。

4

讲授

课程目标3

合计

七、实验内容、基本要求与学时分配

序号

实验项目名称

实验内容与要求

学时

类型

对应课程目标