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结构生物学研究中的新进展
随着科技的不断进步,结构生物学也在不断发展和进步。结构
生物学主要研究生物分子的结构和功能,如蛋白质、核酸、碳水
化合物等。广泛应用于新药研发、生命科学和医学领域。近年来,
随着各种高分辨率技术的发展,结构生物学也取得了一些新的进
展。
一、单粒子冷冻电镜技术
单粒子冷冻电镜技术(singleparticlecryo-electronmicroscopy,
cryo-EM)是一种高分辨率结构生物学技术。该技术可在几乎自然
状态下,高分辨率地解析生物大分子的三维结构。该技术与传统
X射线晶体学(X-raycrystallography)和核磁共振技术(NMR)
不同,前者需要高纯度的蛋白质晶体,后者对样品有比较严格的
要求。而常规电子显微镜在高分辨率下又存在样品极易受损的问
题。相比之下,cryo-EM技术几乎可以处理所有的生物大分子样
品,且在高分辨率下还能保持生物大分子之间的自然状态。
近几年,随着谷歌的Deepmind公司研究人员开发了结合深度
神经网络的自动化软件Relion用于处理cryo-EM数据,从而加速、
最大程度地自动化了数据处理的过程,使得cryo-EM技术更容易
实现。
二、膜蛋白结构研究
膜蛋白在生物体内的重要性不言而喻,它们负责细胞内外物质
的交换和信号传导等功能。在过去,由于其高度水溶性和不稳定
性,使得膜蛋白的结构研究相对困难,很少有高分辨率的结构信
息被得到。但凭借电镜技术的不断发展和导入,在不同解析度下,
越来越多的膜蛋白结构被揭示。
最近,有越来越多的研究表明,有机溶剂结构导向法(organic
solventmodulationmethod)可被用于澄清膜蛋白的结构。该方法
将有机溶剂(如丙酮、甲醇、氯仿和戊酸)加入到膜蛋白样品中,
利用溶剂的高度极性和疏水特性,对膜蛋白的结构进行一定的修
饰,使其成为X射线晶体学和NMR方法所能解析的样品。
三、仿生学用于结构生物学的研究
仿生学是研究生物体和生命系统的结构、功能和行为等特征,
并提取这些特性来设计、制造和应用新的材料、设备和系统的跨
学科领域。在结构生物学中,仿生学也很有应用价值。
跨膜离子通道可以视为自然界中存在的同质纳米孔,是生物体
内外离子输运的关键通道。仿生学研究可对跨膜离子通道的结构
和功能进行深入的掌握以及更有利的设计。例如,一个可能的应
用是采用仿生学方法设计出人工合成的离子通道,用于制造新型
电子元件或用于澄清水处理等方面。
四、结合计算方法进行结构研究
结构生物学是通过实验的方法来获取生物大分子的结构信息。
但是,由于各种原因,如样品的制备和实验过程中的损伤等,实
验所获得的结构信息往往存在可能的瑕疵。为了更准确地解析生
物分子的结构,近年来,越来越多的研究采用计算方法对实验所
获得的结构信息进行优化和完善。
常见的计算方法包括分子力学模拟、分子动力学模拟、分子对
接、分子互作等.这种方法可以同时使用实验所获得的结构信息并
结合计算技术,进一步推导及优化结构,从而更好地揭示生物大
分子的结构与功能。
结构生物学的新进展,以cryo-EM技术的发展及其在膜蛋白的
解析和仿生学的应用为热点,吸引着越来越多的科学家和研究者
走进这一领域。在不久的将来,相信我们可以看到更多的新进展,
更多地揭示生物大分子的奥秘,促进生物、医学等领域的快速发
展。
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