数据库建立乳腺癌自噬相关基因预后预测模型及其应用.pdfVIP

·794·中国病理生理杂志ChineseJournalofPathophysiology2023，39（5）：794-801

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［文章编号］1000-4718（2023）05-0794-08

基于TCGA数据库建立乳腺癌自噬相关基因

预后预测模型及其应用*

1△21

吴珏堃，熊志勇，陈翠

1

（中山大学附属第三医院甲状腺乳腺外科，广东广州510630；

2中山大学附属第三医院岭南医院普外科，广东广州510663）

［摘要］目的：基于自噬相关基因构建乳腺癌患者的预后风险模型。方法：TCGA数据库中下载乳腺癌及

正常乳腺组织的转录组数据和临床信息，首先筛选出差异表达的基因，然后从中选取自噬相关基因，利用LASSO回

归分析等构建预后风险模型，并应用ROC曲线评估模型的预测能力；收集中山大学附属第三医院甲乳外科2022年

9月~2022年11月乳腺癌手术标本26例，采用免疫组织化学法和RT-qPCR法检测临床样本中乳腺癌自噬相关基因

-、和

IL24和PPP1R15A在肿瘤组织和癌旁组织中的表达情况，RT-qPCR法检测乳腺癌临床样本中ESR1PGRERBB2

-

的表达量，进行IL24和PPP1R15A与病理特征的相关性分析。结果：分析得到的29个基因的表达谱数据，采用

LASSOCox回归分析构建预后风险模型。经过回归分析，得到了预测乳腺癌预后最优的基因及其相关系数，自噬基

因的预后风险模型公式为：−Exp（IL-24）×0.5328−Exp（PPP1R15A）×0.3985。根据模型计算每个乳腺癌患者的风

险值，根据中位数将患者分为高风险组和低风险组。为增强模型验证的可靠性，将患者随机分为测试组和验证组

分别验证。测试组Kaplan-Meier生存分析中P0.01，高风险组的5年生存率为76.3%，低风险组的5年生存率为

84.5%；验证组Kaplan-Meier生存分析中P=0.022，高风险组的5年生存率为77.9%，低风险组的5年生存率为

89.3%。ROC曲线分析显示，在测试组中预后风险模型对乳腺癌患者1、3、5年总生存期预测的AUC值分别为

0.746、0.706和0.615；在验证组中预后风险模型对乳腺癌患者1、3、5年总生存期预测的AUC值分别为0.594、

0.553和0.592。分析了风险因素与临床变量［雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和人表皮生长因子受体2

（HER2）］之间的关系。结果显示，ER组阴性的风险评分高于阳性（t=8.521，P0.05），PR组阴性的风险评分高于

阳性（t=7.714，P0.05），HER2组0、1+、2+之间风险评分无显著统计学差异，但是3+的风险评分高于1+（t=3.264，

P0.05）和2+（t=3.772，P0.05）。单因素Cox回归和多因素Cox回归分析显示，风险评分均是是乳腺癌患者的独

立预后因素。在收集的临床样本中