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海南广藿香和石牌广藿香转录组测序功能注释和基因表达分析
摘要
广藿香是一种重要的药用和经济植物,含有超过24种独特的倍半萜化合物,其中最丰富的是广藿香醇。由于它的特殊的药用和经济价值,因此在世界许多地方都有种植。不同品种广藿香由于内部影响因素和外部环境因素的刺激下,所含的广藿香活性物质成分有所不同。为能够快速的挖掘出广藿香次生代谢产物生物合成途径的关键酶基因,提高广藿香有效代谢物的含量,本研究利用转录组测序技术,获得了海南广藿香和石牌广藿香的转录组数据,对比数据库将基因功能进行注释。其中16241个基因注释到KOG库中(35.78%),NR库注释到29042个基因(6
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