HLA-DRB1 01等位基因的SNP为NHL发病因素研究.docx

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摘要

近年来，基于基因组测序的全基因组关联分析（GWAS）迅速发展，许多研究通过GWAS已经观察到人类白细胞抗原（HLA）基因上多个等位基因的单核苷酸多态性（SNP）在白种人中与非霍奇金淋巴瘤（NHL）及其亚型的发病率有关。然而，由于NHL的发病率及亚型比例存在显著的地区差异，因此提示决定汉族人NHL发病率的HLA等位基因的SNP可能与白种人不同。在本次研究中，我们收集了汉族人群中50例不同NHL亚型患者和50例健康人群的淋巴细胞核基因组DNA，通过基因测序，病例对照研究和统计分析评估了两个SNP位点，即HLA-DRB1*01的SNP位点和HLA-DRB1*04的SNP位点与NHL及其亚型发病率的相关性。我们发现HLA-DRB1*01的SNP位点与汉族人群NHL的发病率显著相关且为NHL发病的危险因素（OR=1.625，P＜0.05），而HLA-DRB1*04的SNP位点则为NHL发病的保护因素;在这两个SNP位点阳性的患者中，BCL和TCL这两大NHL亚型的发病率并无显著差异（P＞0.05），此外，我们还发现该SNP位点与患者较差的预后之间无相关性（P＞0.05）。因此，我们得出的结论就是HLA-DRB1*01等位基因的SNP为NHL发病的危险因素，而HLA-DRB1*04等位基因的SNP为NHL发病的保护性因素；BCL和TCL的发病率在这两个SNP位点存在时无显著差异，并且这两个SNP位点的存在与患者较差的预后无相关性。

关键词：非霍奇金淋巴瘤、人类白细胞抗原基因、单核苷酸多态性、基因测序

Recently,genome-wideassociationstudies(GWAS)basedonDNAsequencingaredevelopingrapidlyandmanyresearcheshaveobservedthatmanySNPsondifferentHLAallelesarerelatedtotherisksofNHLinCaucasianpopulations.However,theincidenceandsubtypeportionofNHLisdiverseindifferentregions,sotheSNPsonHLAallele,whichdeterminetheincidenceofNHL,maybesubstantiallydifferentintheChinesepopulations.Inthisresearch,wecollectedthenucleargenomeDNAinlymphocytesof50patientswithdifferentNHLsubtypesandof50controlswhoarecancer-free.WeassessedtherelevancebetweentheincidenceofNHLandtwoSNPs,whichislocatedinHLA-DRB1*01alleleandHLA-DRB1*04allelerespectively,throughDNAsequencing,case-controlstudiesandstatisticalanalysis.WefoundthattheSNPonHLA-DRB1*01alleleissignificantlyrelatedtotheincreasedmorbidityofNHLanditisariskfactorofNHL(OR=1.625，P＜0.05)，butSNPonHLA-DRB1*04alleleisaprotectivefactorofNHL;amongthosepatientswhohavethoseSNPs,theincidenceofBCLandTCLhasnosignificantdifference.Additionally,wealsofoundthatthetwoSNPsareunrelatedtothepoorprognosisinNHLpatients.Therefore,weconcludedthattheSNPon

HLA-DRB1*01alleleplaysanimportantroleintheincreasedincid