真核生物基因表达调控.ppt

真核和原核生物启动子的比较第31页,共58页，星期六，2024年，6月第32页,共58页，星期六，2024年，6月2.增强子：能使与它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列1增强效应十分明显:10---200倍,甚至上千倍2增强效应与其位置和取向无关3没有基因专一性,与不同的基因组合均表现增强效应4其增强效应有严密的组织性和细胞特异性,只有特定的转录因子参与才能发挥其功能5许多增强子还受外部金属离子等调控第33页,共58页，星期六，2024年，6月3沉默子silencer负性调控元件，它与转录抑制因子结合抑制转录。最早在酵母中发现，以后在T淋巴细胞的T抗原受体基因的转录和重排中证实其存在。沉默子的作用特点：不受序列方向的影响，能远距离发挥作用，第34页,共58页，星期六，2024年，6月绝缘子4、绝缘子（insulator）：能阻止正调控或负调控信号在染色体上的传递，阻断包括增强子，沉默子的作用，是染色质活性限制在一定结构域之内。第35页,共58页，星期六，2024年，6月（二）反式作用因子反式作用因子指能与顺式作用元件结合的真核转录调节蛋白，因编码反式作用因子的基因与被反式作用因子调控的靶序列（基因）不在同一染色体上而得名。反式作用因子识别/结合顺式作用元件中的靶序列启动转录例：转录因子TFⅡD识别结合TATAbox

转录因子SP1识别结合GCbox第36页,共58页，星期六，2024年，6月第37页,共58页，星期六，2024年，6月第38页,共58页，星期六，2024年，6月反式因子有两个必需的结构域

DNA结合结构域：与顺式元件识别、结合转录激活结构域：与其他蛋白质结合蛋白质图15-9第39页,共58页，星期六，2024年，6月螺旋-转角-螺旋（helix-turn-helix，HTH）这类结构至少有两个α螺旋其间由短肽段形成的转角连接，两个这样的motif结构以二聚体形式相连，距离正好相当于DNA一个螺距（3.4nm）,两个α螺旋刚好嵌入DNA的深沟。1.反式作用因子（DNA结合域）结构模式

第40页,共58页，星期六，2024年，6月第41页,共58页，星期六，2024年，6月Helix-turn-helixα螺旋-β转角-α螺旋最常见DNA结合域之一例：CAP(最早在原核生物中发现）α螺旋识别、进入DNA双螺旋结构的大沟第42页,共58页，星期六，2024年，6月锌指（zincfinger），每个重复的“指”状结构约含23个氨基酸残基，锌以4个配位键与4个半胱氨酸、或2个半胱氨酸和2个组氨酸相结合。整个蛋白质分子可有2-9个这样的锌指重复单位。每一个单位可以其指部伸入DNA双螺旋的深沟，接触5个核苷酸。例如与GC盒结合的转录因子SP1中就有连续的3个锌指重复结构。第43页,共58页，星期六，2024年，6月Zinc-fingers锌指最常见DNA结合域之一约有30个AA残基其中4个AA残基（2个Cys，2个His或4个Cys）配位键Zn2+锌指与DNA双螺旋大沟结合。存在于多种真核转录因子具多个锌指结构第44页,共58页，星期六，2024年，6月碱性-亮氨酸拉链（basicleucinezipper，bZIP）这结构的特点是蛋白质分子的肽链上每隔6个氨基酸就有一个亮氨酸残基，结果就导致这些亮氨酸残基都在α螺旋的同一个方向出现。两个相同结构的两排亮氨酸残基就能以疏水键结合成二聚体，这二聚体的另一端的肽段富含碱性氨基酸残基，借其正电荷与DNA双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合。第45页,共58页，星期六，2024年，6月Leucine-zippers

亮氨酸拉链一段肽链中每隔6个AA即有一个Leuα螺旋亲水面：亲水AA组成疏水面：Leu组成（亮氨酸拉链条）可形成二聚体（发挥作用）DNA的结合域：拉链区以外结构第46页,共58页，星期六，2024年，6月这类蛋白质的DNA结合结构域实际是以碱性区和亮氨酸拉链结构域整体作为基础的。第47页,共58页，星期六，2024年，6月碱性亮氨酸拉链模体第48页,共58页，星期六，2024年，6月螺旋-环-螺旋:helix-loop-helix:两个双性的α螺旋被非螺旋的环状结构所隔开,蛋白质的氨基端则是碱性区,其DNA结合特性与亮氨酸拉链类蛋白相似.第49页,共58页，星期六，2024年，