TMT（TandemMass Tag）标记定量蛋白质组学分析报告.pdf

TMT（TandemMassTag）标记定量

蛋白质组学分析报告

项目名称

TMT标记定量蛋白质组学

合同编号

XXXXXXXX

项目样本信息

物种信息XX

客户信息

XX

客户姓名

XXXXXXXXXX

客户单位

杭州联川生物技术股份有限公司

杭州钱塘新区下沙号大街号中自科技园幢层

6260164

邮编：

310018

目录

1.项目结果展示

1.1样本标记相关信息

1.2蛋白质定性结果展示

1.3蛋白质定量结果统计

2.进阶生物信息学分析

2.1生物信息分析内容

2.2GeneOntology(GO)功能注释

2.3差异表达蛋白质GO富集分析

2.4KEGG通路注释

2.5差异表达蛋白质KEGG通路富集分析

2.6蛋白质聚类分析（Clustering）

3.质量控制

3.1预实验结果

3.1.1蛋白质抽提、定量、SDS检测

3.1.2预实验结论

3.2标记效率质控

3.3仪器状态质控

3.4质谱鉴定和定量结果评估

3.4.1肽段离子得分分布

3.4.2蛋白质相对分子质量分布

3.4.3蛋白质等电点分布

3.4.4肽段序列长度分布

3.4.5蛋白序列覆盖度分布

3.4.6鉴定肽段数量分布

3.4.7蛋白质丰度比分布

3.4.8火山图（Volcanoplot）

4.项目流程及实验方法简介

4.1TMT原理

4.2项目流程

4.3数据分析流程

4.4实验方法

杭州联川生物技术股份有限公司

杭州钱塘新区下沙号大街号中自科技园幢层

6260164

邮编：

310018

4.4.1实验仪器和分析软件

4.4.2试剂和耗材

4.4.3蛋白质抽提

4.4.4SDS电泳

[8]

4.4.5FASP酶解

4.4.6TMT标记

4.4.7HighPHRP分级

4.4.8质谱分析

4.4.9数据分析

4.5生信分析方法

4.5.1GeneOntology(GO)功能注释

4.5.2KEGG通路注释

4.5.3GO注释与KEGG注释的富集分析

4.5.4蛋白质聚类分析(Clustering)

5.输出文件及保存位置

5.1输出文件注释说明

5.2输出文件保存位置

6.参考文献

杭州联川生物技术股份有限公司

杭州钱塘新区下沙号大街号中自科技园幢层

6260164

邮编：

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1.项目结果展示

1.1样本标记相关信息