分子诊断学之核酸扩增技术-聚合酶链反应技术.pptxVIP

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1一、聚合酶链反应技术

polymerasechainreaction,PCR(一)PCR技术发展简史(二)PCR技术原理(三)PCR反应体系、条件及其优化(四)扩增产物检测及分析(五)PCR常见问题与原因分析(六)PCR衍生技术

2聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction,PCR)是指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。是DNA体外合成放大技术,能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。概念

31953年,Watson和Crick提出DNA双螺旋结构及半保留复制模型。1958年,Meselson和Stahl用实验证实DNA半保留复制模型。70年代以来,人们采用两种思路去尝试建立基因的无性繁殖体系,一是基因克隆技术,二是体外扩增技术。(一)PCR技术发展简史

41971年,Khorana(美国MIT教授,1968年诺贝尔医学奖得主):“经过DNA变性,与合适引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因。”核酸体外扩增最早设想被遗忘原因:(1)很难进行测序和合成寡核苷酸引物;(2)1970年Smith等发现了II型限制性内切酶,体外克隆基因已成为可能。

51976年,台籍科学家钱嘉韵(AliceChien)从黄石国家公园的嗜热菌Thermusaquaticus中分离出热稳定的TaqDNA聚合酶。1985年,美国Cetus公司人类遗传研究室的KaryMullis发明PCR反应,Saiki等首次应用PCR法成功地扩增了人?-珠蛋白的DNA,并应用于镰刀状红细胞贫血的产前诊断。

6inventedbyKarryB.Mullis(1983,NobelPrize1993) patentsoldbyCetuscorp.toLaRochefor$300milliondependsonthermo-resistantDNApolymerase(e.g.Taqpolymerase)andathermalcycler

71988年Saiki开始将耐热性TaqDNA聚合酶应用于PCR,整个反应只加一次酶即可,扩增特异性和效率都明显改善,操作大为简化。1989年被誉为“分子年”,列PCR为十余项发明之首。1993年,Mullis荣获诺贝尔化学奖。

8(二)PCR的基本原理试管中进行的DNA复制反应,依据DNA半保留复制的机理;体外DNA分子于不同温度下可变性/复性;通过人为控制体外合成系统的温度,使双链DNA变成单链,单链DNA与人工合成的引物退火,DNA聚合酶使引物沿着单链模板延伸为双链DNA。

91)变性,加热至95℃,使模板DNA解开成单链;2)退火,温度降至适宜,使引物与模板互补结合;3)延伸,温度升至72℃,DNA聚合酶以4种dNTP为底物,在引物的3’-OH上,合成与模板互补的DNA新链。加热变性复性复温

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11PCR循环–第一步–高温变性

12Tm值Tm即溶解温度(meltingtempreture),也叫解链温度。是指当双链解链到A260最大值的一半时的温度。它的高低由DNA分子中G、C含量的百分比决定。

13PCR循环–第二步–引物与靶序列退火

14Basepairingduringrenaturation

15PCR循环-第三步-引物延伸

16第1个PCR循环完成后–

得到两个拷贝的靶序列

1730次循环后靶序列扩增的数量No.of No.AmpliconCycles CopiesofTarget1 22 43 84 165 326 6420 1,048,57630 1,073,741,824

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20理论扩增率:2n递增(n为循环次数),25~30循环,目标DNA可增加109倍。实际扩增率:(1+X)n,X为PCR的实际扩增率,平均约为75%。由于引物和底物的消耗,酶活力的下降等因素,扩增产物的增加,逐渐由指数形式变为线性形式,所以实际上进行30个循环后,扩增倍数一般可达106~107。以上“变性、退火、延伸”三部曲为PCR一轮循环。

21反应体系模板(DNA或RNA)引物TaqDNA聚合酶10×PCR缓冲液1.5~4mMMg2+0.2mMdNTP反应流程预变性变性退火延伸延伸完全终止25~35循环(三)PCR反应体系、条件及其优化

22模板DNA引物TaqDNA聚合酶4种dNTP含Mg2+的缓冲液。PCR的反应体系

23PCR反应条件变性95?C延伸72?C退火Tm

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