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·论著·

医学研究杂志２０２１年５月第５０卷第５期

生物信息学分析胰腺癌组织关键基因表达及其意义

王乾合赵立然朱克祥

摘要目的利用生物信息学方法对ＧＥＯ数据库进行探索，获取胰腺癌发生、发展的核心基因，分析胰腺癌发生、发展的

潜在机制。方法使用ＧＥＯｑｕｅｒｙ包从ＧＥＯ数据库获取胰腺癌相关芯片数据（ＧＳＥ６２４５２），利用Ｌｉｍｍａ包进行差异分析，结合

ｃｌｕｓｔｒｅＰｒｏｆｉｌｅｒ包对上调基因和下调基因分别进行ＧＯ功能和ＫＥＧＧ通路分析，利用Ｓｔｒｉｎｇ在线网站对差异基因进行蛋白互作网

络分析，利用Ｃｙｓｔｏｓｃｏｐｅｓ软件筛选出核心基因，最后借助ＴＣＧＡ数据库和芯片数据（ＧＳＥ２８７３５）对核心基因进行再次验证。结果

利用生物信息学方法共获得２８６个差异基因，其中包含上调基因１８９个，下调基因９７个。富集分析结果显示上调基因涉及细胞

组织黏附、细胞外基质组织构成等功能以及蛋白消化与吸收、ＰＩＫ－Ａｋｔ等信号通路相关。下调基因与脂类消化、细胞壁破裂等

３

功能和胰腺分泌等信号通路密切相关。通过蛋白互作网络筛选出２０个关键基因，利用ＧＥＰＩＡ数据库对关键基因进行生存分析

验证，发现３个基因（ＭＭＰ１１、ＬＡＭＢ３、ＰＬＡＵ）与胰腺癌预后明显相关。结论通过生物信息学方法最终筛选出３个核心基因，为

胰腺癌的诊断和预后提供了新的思路。

关键词胰腺癌靶向治疗ＧＥＯ

中图分类号Ｒ７３文献标识码ＡＤＯＩ１０．１１９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７３５４８Ｘ．２０２１．０５．００９

ＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎｄＳｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅｏｆＫｅｙＧｅｎｅｓｉｎＰａｎｃｒｅａｔｉｃＣａｎｃｅｒＴｉｓｓｕｅｓ：ＡＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓ．ＷａｎｇＱｉａｎｈｅ，ＺｈａｏＬｉｒａｎ，ＺｈｕＫｅｘ

ｉａｎｇ．ＴｈｅＦｉｒｓｔＣｌｉｎｉｃａｌＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｇｅ，ＬａｎｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＴｈｅＦｉｒｓｔＨｏｓｐｉｔａｌｏｆＬａｎｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇａｎｓｕ７３００００，Ｃｈｉｎａ

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