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非编码RNA研究专题03非编码RNA基础microRNA.pptx

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?非编码RNA基础——microRNA解螺旋|知识金牌

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌010203历史机制高通量技术与microRNACONTENTS课程目录

历史01

知识金牌从RNAi到microRNARNAi:1990年1994年1995年1998年矮牵牛中发现粗糙脉孢菌线虫Fire和Mello阐明了其原理,并于2006年因此获得了NobelPMPrizemicroRNA:1993年由VictorAmbros和GaryRuvkun分别发现第一个microRNA是lin-4被称为“小分子时序RNA”(stRNA)解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌七年之后再起征1990年,人类基因组计划正式启动越来越多的物种被测序:流感嗜血杆菌、大肠杆菌、酿酒酵母、线虫等到了2001年,已有越来越多的microRNA被发现2001年10月,Tuschl、Bartel和Ambros三人在Science上撰文,将其命名为microRNA,简称miRNA解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌动物miRNA的合成经过Drosha切割,形成60~70nt长度的茎环结构pre-miRNA核DNA转录pri-miRNA通过Exportin5进入细胞质经Dicer切割茎环,形成双链小RNA双链RNA解体,形成成熟miRNA装配形成miRISC不完全匹配结合在3’UTR,抑制靶基因蛋白翻译完全匹配,靶基因mRNA降解解螺旋|陪伴医生科研成长

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌pre-miRNA (前体)stem-loop茎环结构左右两臂均可以产生成熟microRNA是预测新microRNA的基础成熟miRNA存在于胞质中以及广泛分布于远端组织、体液中动物miRNA的合成

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌网址 是综合性的收录microRNA及其前体信息的网站特点:①全面、权威;②包括成熟序列及前体序列③用miR-Seq数据来发现及校正microRNA④提供靶基因数据库的外部链接及wiki词条模块⑤在线搜索及查询综合数据库miRBase

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌综合数据库miRBase

机制02

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌miRNA的作用机制转录后抑制切割mRNA降解mRNA核内增强mRNA的表达

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌3·UTR有多个miR结合位点miR有多种结合3`UTR方式一条microRNA可以调控数百条mRNAmiR与3`UTR

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌与lncRNA相互作用lncRNA也是可以有3`UTR的miR与lncRNA

知识金牌miRNA与circRNA(Ashwal-Flussetal.,2014)解螺旋|陪伴医生科研成长circRNA是一种长链环状非编码RNA分子miRNA与circRNA结合形成所谓的”miRNASponge”circRNA如同海绵一样“吸附”多种miRNA,从而阻止miRNA行使原有功能circRNA与mRNA形成了所谓的”ceRNA”关系

知识金牌hsa-mir-19hsa-mir-19ahsa-mir-19b-1hsa-miR-19b-1-5phsa-miR-19b-3phsa-mir-19b-2hsa-miR-19b-2-5phsa-miR-19a-5phsa-miR-19a-3phsa-mir-19a*hsa-miR-19b-1*hsa-miR-19b-2*miRNA的命名体系解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌miRNA的命名体系解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌循环miRNA2008年,发现血清中稳定存在游离的miRNA随后,在血浆、唾液、尿液等体液以及牛奶等中均发现了循环miRNA的存在循环miRNA的来源主要有三种:①细胞或组织被动释放出来的miRNA;②外泌体主动分泌的miRNA;③仅与蛋白结合的miRNA。被引次数2500+解螺旋|陪伴医生科研成长

解螺旋 | 陪伴医生科研成长miRNA的跨物种调控 知识金牌2018年,菟丝子的miRNA能够跨物种靶向寄主mRNA从而调控其基因表达2012年,南京大学张辰宇的一篇文章,发现食物中的外源植物miRNA可以调控哺乳动物靶基因表达

高通量技术与microRNA03

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