非编码RNA研究专题04非编码RNA基础lncRNA.pptx

?非编码RNA基础——lncRNA解螺旋|知识金牌

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌010203lncRNA基础lncRNA作用机制lncRNA研究策略CONTENTS课程目录

lncRNA基础01

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解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌lncRNA定义5longnon-codingRNA200nt转录、但基本不翻译蛋白发挥多种功能大家熟悉的lncRNA举例：X染色体失活：Xist基因组印记：H19反式基因调控：HOTAIR细胞核运输：NronlncRNA同时在细胞核和细胞质内发挥功能http://www.rikenresearch.riken.jp/eng/frontline/5920

lncRNA历史三部曲 知识金牌解螺旋|陪伴医生科研成长1980s-1990s:IndividuallncRNAsarediscoveredthroughtraditionalgenemappingapproaches,XistandH19.第一阶段：传统的基因定位； Early2000s:DevelopmentoflargescalecDNAsequencingleadstothediscoveryofasurprisingnumberoflncRNAtranscripts.第二阶段：大规模的cDNA文库测序 Mid2000s:ThenumberofpredictedgenesinthemammaliangenomegoesdownandthenumberofdetectedlncRNAtranscriptsincreasesexponentially.第三阶段：新一代测序技术

知识金牌lncRNA来源概览编码mRNA基因的突变解螺旋|陪伴医生科研成长染色体重排染色体重复转座子插入

知识金牌lncRNA分类KnaussandSun,Neuroscience2013解螺旋|陪伴医生科研成长基本按照与mRNA位置来定义的五大分类

知识金牌lncRNA数据库——NCBI解螺旋|陪伴医生科研成长

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌lncRNA数据库——UCSC、Ensembl

知识金牌lncRNA数据库——LNCipedia/目前只收录人源lncRNA2013年由比利时根特大学建立收录lncRNA的基因信息和转录本信息预测lncRNA编码潜力目前有各类记录十余万条解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌lncRNA数据库——lncrnadb/解螺旋|陪伴医生科研成长收录经人工整理的记录被NONCODE、RNACentral、HGNC等所引用最后更新为2015年11月

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌lncRNA数据库——LncRBasehttp://bicresources.jcbose.ac.in/zhumur/lncrbase/index.html基于特征序列来分析IncRNA功能的注释数据库收录人和小鼠的lncRNA最后更新时间：2016年秋

解螺旋 | 陪伴医生科研成长lncRNA数据库——NONCODE 知识金牌/以lncRNA为核心内容的综合性数据库除自身外，收录了来自LNCipedia、LncRBase等多个数据源的数据，最大最全更新较及时

知识金牌lncRNA数据库——LncBase解螺旋|陪伴医生科研成长http://carolina.imis.athena-innovation.gr/diana_tools/web/index.php?r=lncbasev2%2Findex主要收录lncRNA与mRNA间的关系记录包括实验来源的与经预测得到的

知识金牌lncRNA数据库——LncRNAWiki/index.php/Main_Page仅收录人lncRNA维基式百科全书属于BIGD的一部分解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌lncRNA数据库——LncRNADisease/lncrnadisease收录lncRNA与疾病间的关系最后更新：2017年7月26日同样被BIGD所收录解螺旋|陪伴医生科研成长

lncRNA作用机制02

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌从转录角度