蛋白质组学系列讲座05基于质谱的蛋白质组学数据分析与应用案例解析.pptx

?基于质谱的蛋白质组学的相关数据分析及应用案例解析解螺旋|知识金牌

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金白质组学简介蛋白质组学经典实用案例新一代蛋白质组学技术-DIADIA优势服务供应商CONTENTS课程目录

蛋白质组学简介01

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌生物医学领域研究热点DNARNAProteinsMetabolites内源性小分子（＜1200Da）GenotypePhenotypeGenomics-22,000genes可能发生什Transcriptom么ics？-100,000transcripsProteomics-1000,000proteoforms正在发生什么？Metabolomic＞5,000compoundsLipidomics＞30,000species已经发生了什么？

知识金牌蛋白质组学研究现状34846250259168864677695611251122401641784537533959315162583161736801614550004000300020001000060007000时间：2018年1月1日 数据库：NCBI-Pubmed位置：Title/Abstract-Completion 词 汇：proteome,proteomic,proteomics蛋白组学研究论文年度递增2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017中国 世界解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌2016蛋白质组学研究进螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌蛋白质组学分类定性样本中都含有那些蛋白？这些蛋白分别是什么？解螺旋|陪伴医生科研成长定量Labelfree/iTRAQ/TMT/SILAC/DIA同一蛋白在不同样本中含量谁高谁底？修饰磷酸化、乙酰化靶向、泛素化、甲基蛋白在化翻…译后PRM/WB/ELISA前期实验获得的数据是否可靠？修饰水平上发生了哪些变化？

知识金牌蛋白质组学流程样本处理（液氨研磨、二氧化碳研磨、超声破碎等），蛋白抽提、定量（Bradford、BCA法）、SDS跑胶等蛋白提取蛋白酶解、肽段抽提及纯化。修饰类的蛋白质组学需在肽段提取好之后增加一步富集（磷酸化、泛素化、乙酰化）肽段提取肽段进行一维色谱分离分级（级数可选）、质谱上机进行电离、分离、能量碰撞后获得实验碎片离子信息LC-MS对质谱实验所获得的碎片离子进行进一步分析，还原出待测样本中的肽段和蛋白的具体信息样本信息解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌生物信息学分析聚类热图GO注释蛋白互作KEGG通路解螺旋|陪伴医生科研成长

蛋白质组学经典实用案例分享02

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌生命科学研究方向应用思路产品性状品质、口感遗传多样性分子机理胁迫、应激生长发育细胞全能性果实成熟机理样本组成肠道微生物环境微生物大规模修饰位点鉴定分子机制研究

解螺旋 | 陪伴医生科研成长蛋白质组学——标志物筛选（胃癌） 知识金牌IdentifcationofspecificbiomarkersforgastricadenocarcinomabyiTRAQproteomicapproach.Sci.Rep.,2016.IF=4.26差异蛋白筛选生信分析：Pathway与PPIWB验证ANXA1和UQCRC1是较好的GC早期诊断标志物ANXA1和UQCRC1的病理学验证细胞系验证：基因敲除与过表达验证ANXA1功能发现关键蛋白：MMNT,FBLN5,ANXA1,UQCRC1蛋白定量、还原、烷基化、酶解、标记11331A11431B11510A11610B1175A1185B119101A121101B强阳离子交换色谱分离反向色谱-串联质谱分离和鉴定SDS预实验

解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌蛋白质组学——分子机理（高脂饮食）ExtendedmultiplexingofTMTlabelingrevealsageandhighfatdietspecificproteomechangesinmouseepididymaladiposetissue.Mol.Cell. Proteomics.,2017.IF=6.54基础代谢检测TMT实验流程图体重、组织重量、葡萄糖、胰岛素、胆固醇、甘油三酯;葡萄糖和胰岛素耐受实验等。差异蛋白