蛋白质组学系列讲座03蛋白质组学案例分享.pptx

?蛋白质组学案例分享解螺旋|知识金牌

知识金牌CONTENTS课程目录案例分享解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌应用案例1解螺旋|陪伴医生科研成长Label-freequantitativeproteomicprofilingofcoloncancercellsidentifiesacetyl-CoAcarboxylasealphaasantitumortargetofCitruslimon-derivednanovesicles应用非标记定量蛋白质组学技术在结肠癌细胞系中研究发现乙酰辅酶A羧化酶a是柠檬中提取的纳米囊泡的抗肿瘤靶点实验样本：人结肠癌细胞系主要技术：LFQ发表期刊：JournalofProteomics影响因子：3.91

知识金牌应用案例1定量蛋白:1738差异蛋白:24上调蛋白:8下调蛋白:16差异蛋白筛选标准：Foldchange(FC)≥±2p-value0.05Uniquepeptides≥±2应用DAVID数据库对上调蛋白进行功能聚类；String数据库分析发现上调蛋白PAK1和CDC37均参与细胞应激反应。应用DAVID数据库对下调蛋白进行功能聚类；解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌应用案例1应用Reactome数据库对下调蛋白信号通路分析；发现其参与DHCR24、DDHD1、以及ACACA介导的脂代谢DDHD1、ACACAFC=?23.87;P=4.35E-07.肿瘤细胞特异性基质细胞解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌应用案例1ACACA特异性诱导肿瘤细胞凋亡，抑制肿瘤细胞生长。ACACA通过抑制MAPK信号通路抑制细胞增长，并通过BAD因子促进细胞凋亡。解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌应用案例2解螺旋|陪伴医生科研成长LysineMalonylationIsElevatedinType2DiabeticMouseModelsandEnrichedinMetabolicAssociatedProteins2型糖尿病小鼠模型中赖氨酸丙二酰基化水平上调，并且代谢相关蛋白表达量升高。实验样本：小鼠肝脏组织主要技术：修饰蛋白质组学发表期刊：MolCellProteomics影响因子：6.54

知识金牌应用案例2在WT和db/db鼠的肝脏组织中检测赖氨酸的7种酰基化修饰在WT、db/db以及ob/ob鼠的肝脏组织中检测赖氨酸丙二酰基化LC-MS/MS鉴定蛋白赖氨酸丙二酰基化位点解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌解螺旋 | 陪伴医生科研成长应用案例2丙二酰基化蛋白质组学检测定量蛋白：268个。丙二酰基化位点：573个。应用String数据库分析丙二酰基化蛋白的相互作用。KEGG信号通路分析发现db/db鼠中参与糖和脂肪酸代谢的丙二酰基化蛋白表达量升高。

知识金牌解螺旋 | 陪伴医生科研成长应用案例2Wb实验验证质谱结果突变107位赖氨酸，检测ALDOB丙二酰基化活性ALDOB蛋白结构

THANKS解螺旋|知识金牌