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流感病毒的核酸检测技术操作规范
(一)流感病毒ConventionalonestepRT-PCR检测
应用核酸检测技术为疑似流感病毒感染病例诊断提供
依据,为流感病毒的型别和亚型的鉴定提供技术方法。按照
规定方法对标本和病毒进行处理和检测,保证检测结果的快
速性和可靠性,同时确保样本不被污染和污染环境。
1.生物安全要求
实验室操作应当遵守生物安全实验室的有关生物安全
的规定。季节性流感病毒生物安全二级,疑似高致病禽流感
病例标本需在BSL-2级实验室操作,采取BSL-3级防护;核
酸提取及加RNA模板可在BSL-2级实验室生物安全柜内操
作;PCR反应体系配制在体系配制区;PCR产物检测在电泳
区操作。
2.主要试剂(所列厂家仅用作举例,实验室可自行选择)
序号试剂名称货号规格生产商
1One-stepRTPCRkit210212Qiagen
2引物*(20μM)2ODTAKARA
3RNaseinhibitorN2111Promega
注:*引物序列详见表1。
3.设备
(1)BSL-2生物安全柜;
(2)可调转速最大至14000rmp的离心机;
(3)涡旋混合器;
(4)10μL,100μL,200μL,1000μL量程移液器;
(5)PCR仪;
(6)电泳槽和电泳仪;
(7)凝胶成像系统。
4.质量控制
(1)实验检测所需核酸提取试剂和一步法RT-PCR检
测试剂不同批号之间需进行灵敏度的检测。同一试剂不同批
次的灵敏度的检测至少半年一次。
(2)实验检测除待检标本外还需设置阳性对照及阴
性对照,阳性对照核酸事先应稀释分装,经Real-timePCR检
测Ct值在30以内;阴性对照为DEPC处理水Real-timePCR检
测Ct值为0。
5.实验步骤
(1)实验注意事项
由于PCR检测灵敏度高,因此必须采取一些预防污染的
措施,以避免假阳性结果的出现,建议采取如下方法:
a)核酸提取、反应液配制及检测反应进行应在独立的
房间中进行。
b)不同的房间配制相应的专用耗材和设备,不可交叉
使用。
c)配制反应液时,应穿着干净的实验服,带无粉手套
进行操作。
d)实验操作期间,如怀疑有污染,请更换手套。
e)试剂及反应管的盖子应尽可能盖上。
(2)设备准备
操作台的表面、枪头和离心机应保持洁净,可用5%漂白
剂或其它清洁剂,如可以去除DNA酶的试剂擦拭台面,以减
少核酸污染的风险。
(3)试剂准备
注意:配制反应液期间,尽量保持所有试剂放置在低温
装置中,如预冷的冰盒。
a)引物配制
将新合成的引物在开盖前短暂离心(12000rpm,15s)。
用RNaseFreeWater溶解,加水量为10×总摩尔数,充分混
匀,此时引物浓度为100pmol/μL,即100μM。(例如:合成
引物2OD,9.5nmol,则加水量为10×9.5=95μL),可作为
储存液。将100μM的引物浓度再10倍稀释,配成浓度为
10μM,即可直接用于PCR反应。
b)引物准备
融化引物,振荡所有引物,短暂离心引物,然后放置在
低温装置上。
c)ConventionalRT-PCR试剂
将RT-PCREnzymeMix放置在低温装置上,融化
5×RT-PCRBuffer,颠倒混匀
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