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梅山猪与从江香猪杂交后代的FSH-β基因遗传变异分析
粟朝芝;陈林;陈伟;张雄;张凯凯;韩雪
【摘要】为探究FSH-β基因遗传变异对MX猪的影响,实验以从江香猪(♂)×梅山
猪(♀)杂交后代为研究对象,利用PCR扩增技术结合直接测序,对FSH-β基因SNPs
位点进行筛选.结果:FSH-β基因135bp和231bp处分别发生了单核苷酸突变
135G/T、231A/G,遗传学分析显示这2个突变位点所对应的纯合子基因型频率均
为0.8846,杂合子基因频率均为0.1154,多态信息含量(PIC)为0.1121,属于低度多
态,遗传多样性并不丰富;经χ2适合性检验表明,2个位点均不处于Hardy
Weinberg平衡状态(P0.05).
【期刊名称】《贵州畜牧兽医》
【年(卷),期】2018(042)006
【总页数】4页(P13-16)
【关键词】MX猪;FSH-β基因;遗传变异
【作者】粟朝芝;陈林;陈伟;张雄;张凯凯;韩雪
【作者单位】贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵州贵阳550005;贵州大学高原
山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;贵州大学高原山地
动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;贵州省农业科学院畜牧
兽医研究所,贵州贵阳550005;贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵州贵阳
550005;贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵州贵阳550005
【正文语种】中文
【中图分类】S828.2;Q78
促卵泡β亚基(Folliclestimulatinghormonebetasubunit,FSH-β)是促卵泡激
素的2个亚基之一,也是促卵泡激素行使生物功能的主要依赖者,具有促进卵泡
形成和发育的功能,并能诱导动物排卵[1]。研究表明,FSH-β基因已经被确定为
影响猪产仔数的主效基因之一,可将其作为遗传学中有关繁殖性状研究的重要分子
标记[2~4]。高天等[5]研究指出,嘉兴黑猪FSH-β基因第2外显子区域发现了3
个SNPs位点,但突变位点与繁殖性状之间并无显著性关系。刘乙等[2]研究发现,
FSH-β基因多态性对大白猪总产仔数、总活仔数、健仔数等性状都有一定影响。
对非哺乳动物研究表明,雷州黑鸭FSH-β基因突变型个体不管是纯合子还是杂合
子其开产日龄、蛋重以及产蛋数量上都显著高于野生型纯合子个体[6]。
从江香猪是贵州省东南部特有的小型地方猪种,具有逆性强、耐粗饲、肉质鲜美、
营养丰富等特点[7]。本研究利用从江香猪梅山猪(♀)杂交后代(命名为MX猪)为材
料,用PCR扩增结合直接测序的方法,筛选FSH-β基因多态位点(SNPs),同时分
析其在MX猪群体中的遗传变异情况,以期为MX猪品种选育提供分子理论依据。
1材料与方法
1.1试验材料MX猪由贵阳绿生源畜牧科技发展有限公司提供,饲养管理水平相同、
健康无病,随机挑选30头,采集猪耳组织样本,置于95%酒精中保存,送实验室
用于基因组DNA提取。
1.2基因组DNA提取试验采用血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒(购自北京
天根生化科技有限公司,型号:DP304-03)进行基因组DNA提取,微量紫外分光
光度计检测其浓度及D260nm值,1%琼脂糖凝胶检测其完整性,-20℃保存备
用。
1.3引物设计及PCR扩增根据GenBank发布的猪FSH-β基因序列
(NC_010444.4),利用Primer5.0引物设计软件设计3对特异性引物,分别用于
外显子区域的扩增。引物由上海英潍捷基生物有限公司合成,引物信息见表1。
表1FSH-β基因扩增引物信息引物名称引物序列5’-3’预扩增大小(bp)退火温
度(℃)FSH-β-1F:ACAGTGCCAAAGCAATACR:ATGGGAACTCCAAGAAAA680
55FSH-β-2F:AGGAGGAGAATAAGAA-GAR:GAGGGAAGAAATAGACAC1228
57FSH-β-3F:TAGACATAAGGAGTAG-GAAAAGR:AACTAAAGGGGTTG-
GAAA133755
PCR扩增采用3
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