三维定量构效关系.pptVIP

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2024-12-27 发布于北京
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三维定量构效关系.ppt

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LOGOLOGOLOGOLOGO三维定量构效关系（3D-QSAR）CADD基于结构基于机制受体结构（蛋白三维结构已知）分子对接法小分子（已知结构和活性）比较分子场分析法(CoMFA)三维定量构效关系（3D-QSAR）一般研究过程受体拮抗剂或激动剂受体的活性部位形状及作用方式虚拟的受体模型计算如果1组化合物以同样的方式作用于同一靶点，则其生物活性就取决于每个化合物周围分子场的差别，这种分子场可以反映药物分子和靶点之间的非键相互作用特性。用分子场研究药物与受体间的相互作用理论基础比较分子场分析法CoMFA结构优化研究药物的优势构象逐一建造各化合物的分子计算各原子的电荷密度操作过程前期准备比较分子场分析法CoMFA比较分子场分析法CoMFA操作过程分子叠合根据基于公共骨架的叠合、基于能量场的叠合、基于惯性距的叠合、基于药效团的叠合及基于复合物结构的叠合等规则把优势构象重叠在一个能包容全部化合物的空间网格31个甾体化合物的叠合图形01操作过程06立体作用05CH3探针02选择探针04H2O分子07（范德华力力场）10（静电力场）09电性作用03疏水作用和氢键作用08H+探针比较分子场分析法CoMFA01020304操作过程探针每移动一步长，计算其在网格上与各原子相互作用的立体能和静电能+生物活性确定QSAR方程偏最小二乘法交叉验证比较分子场分析法CoMFA比较分子场分析法CoMFA操作过程建立等高线红色负电性基团蓝色正电性基团绿色增大基团体积黄色减小基团体积LOGOLOGOLOGOLOGO