精品医学课件-基于酶促反应原理的药物设计.ppt

以BCR-ABL和Bruton’s酪氨酸激酶（Bruton’styrosinekinase，BTK）2种非受体型PTKs为靶点的小分子抑制剂已成功上市6种药物，靶向BCR-ABL的代表性药物为伊马替尼和达沙替尼（dasatinib，4-43），是治疗慢性粒细胞性白血病的有效药物；而依鲁替尼（ibrutinib，4-44）是唯一的BTK抑制剂，用于治疗套细胞淋巴瘤和急性淋巴性白血病。这些替尼类（-tinibs）药物并不是作用于单一的靶点，对其它激酶也有着较强的抑制活性，从多向药理学（polypharmacology）的角度来说，可能是其临床有效性的原因，另一方面也会由于脱靶效应（off-targeteffect）造成一些不良反应。这些替尼类（-tinibs）药物并不是作用于单一的靶点，对其它激酶也有着较强的抑制活性，从多向药理学（polypharmacology）的角度来说，可能是其临床有效性的原因，另一方面也会由于脱靶效应（off-targeteffect）造成一些不良反应。第四节案例分析：波西匹韦的发现?一、研究背景丙型肝炎由丙型肝炎病毒（HCV）感染所致，主要经血液/体液传播。据世界卫生组织统计，全球HCV的感染率约为3%，约1.8亿人感染HCV，60%~70%的感染人群发病，可导致肝脏慢性炎症坏死和纤维化，部分患者可发展为肝硬化甚至肝癌。HCV是一种高度易变异性病毒，根据其基因序列的差异，可以分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ四种基因型，各基因型间没有免疫力，相互之间可以重复感染，这使得研制预防性和治疗性疫苗的存在很大困难。近5年抗丙型肝炎药物取得重大突破，下面以NS3/4A蛋白酶抑制剂（NS3/4Aproteaseinhibitor）波西匹韦（baceprevir）为例，说明基于酶蛋白结构的合理设计过程。NS3/4A蛋白酶对HCV的生长和增殖具有重要作用，是研究抗HCV药物的理想靶标。NS3/4A蛋白酶单晶X射线分析提示，其活性中心是处于酶的表面，呈平坦状展开，没有明显特征的疏水性结构域，而且被水分子覆盖。催化核心是由N端的His57和Asp81，C端的Ser139三元体构成。底物P1位置为Cys或The，P1为疏水性、小体积氨基酸Ala或Ser，P2、P3和P4为疏水性氨基酸，P5和P6为Asp或Glu等酸性氨基酸残基。二、苗头化合物的发现由于酶与底物的结合以在较大范围发生、多位点的弱结合力为特征，研究筛选小分子化合物以其达到抑制NS3/4A蛋白酶的目的并不成功，而模拟天然底物的长链肽，进行设计与修饰成为有效途径。化合物（4-50）与NS3/4A蛋白酶活性中心的结构匹配，且酮基酰胺处于合适的位置，可与Ser139发生亲核性进攻，形成稳定的共价键，成为不可逆抑制剂，如图4-10所示。图4-10α-酮基酰胺片段与丝氨酸的羟基发生亲核进攻形成共价结合的示意图三、先导化合物的确定及优化1.减少氨基酸残基，由十一肽减为五肽2.改变侧链基团，再减少氨基酸残基四、上市药物波西匹韦候选药物的确定及相关临床信息在临床前研究中，化合物（4-53）表现出良好的开发价值，被命名为波西匹韦（baceprevir），最终在2011年5月上市。波西匹韦（4-53）与NS3/4A复合物单晶X射线衍射图（图4-11）显示，两个叔丁基分别与S4和S3疏水腔发生疏水相互作用，P2的二甲基环丙并脯氨酸片段呈弯曲构象，与酶的Ala156、His57和Arg155侧链发生最大程度的疏水性交盖，环丁基占据了S1腔，α-酮基酰胺的羰基与Ser139形成可逆的共价结合，整个化合物骨架与酶发生多处的氢键结合。图4-11波西匹韦与NS3/4A复合物单晶X射线衍射图本章思考题一、名词解释1、合理的酶抑制剂设计2、非共价结合的酶抑制剂3、基态类似物抑制剂4、多底物类似物抑制剂5、过渡态类似物抑制剂6、基于机理的抑制剂7、亲核标记抑制剂8、不可逆抑制剂二、问答题1、基于结构/机理的非共价结合的酶抑制剂的分类及其特点。2、共价结合的酶抑制剂的类型及其设计思想。3、简述HIV-1逆转录酶抑制剂作用机制4、简述受体型PTKs的结构特征和类型与非受体型PTK的结构特征5、简述NA的结构特点及其代表性抑制剂。*Chapter4.DDSbasedon

Enzymeticreactions本章重点1.掌握酶促反应的基本概念和酶抑制剂设计的基本原理2.熟悉酶抑制剂类药物的发展现状；熟悉NS3/4A蛋白酶抑制剂波西匹韦的设计与发现过程。3.了解HIV-1RT、PTKs和NA等药物作用靶酶的结构、功能和