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天行健,君子以自强不息。地势坤,君子以厚德载物。——《周易》
PCR(聚合酶链式反应)原理
PCR是体外酶促合成特异DNA片段的方法,主要由高温变性、低温退火和适温延伸
三个步骤反复的热循环构成:即在高温(95℃)下,待扩增的靶DNA双链受热变性
成为两条单链DNA模板;而后在低温(37~55℃)情况下,两条人工合成的寡核苷
酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链;在Taq酶的最适温度(72℃)
下,以引物3’端为合成的起点,以单核苷酸为原料,沿模板以5’→3’方向延伸,合成
DNA新链。这样,每一双链的DNA模板,经过一次解链、退火、延伸三个步骤的热
循环后就成了两条双链DNA分子。如此反复进行,每一次循环所产生的DNA均能成
为下一次循环的模板,每一次循环都使两条人工合成的引物间的DNA特异区拷贝数
扩增一倍,PCR产物得以2n的批数形式迅速扩增,经过25~30个循环后,理论上
可使基因扩增109倍以上,实际上一般可达106~107倍。
1971年Kleppe等人在Journalofmolecularbiology上发表文章首次准确、精炼、客
观的阐述了PCR方法,1976年一种从嗜热水生菌(Thermusaquaticus)分离得到的热稳定
的DNA依赖的DNA聚合酶的应用大大增加了PCR的效率。而现今所发展出来的PCR则
是源于由Saiki和Mullis等人于1988年发表在Science上的一篇论文,Mullis当时服务
于PerkinElmer(PE)公司,因此PE公司在PCR界有着特殊的地位。后来PE被Applied
BiosystemsInc.(ABI)公司收购、分拆、再转卖,而PCR的专利和倍受信赖的PCR仪器
生产和销售就留在ABI名下。到如今,PCR方法愈发趋向自动化,并从中衍生出更多的
新技术方法,可以说,PCR技术是支撑现代分子生物学发展的一块重要基石。这种技术
的广泛应用催生了一个庞大的市场,多个公司均有各种类型的商品化PCR仪出售。PCR
的专利目前依然掌握在ABI和Roche(罗氏)两大公司手中,去年业界颇为引人瞩目ABI
诉MJ公司侵犯侵犯PCR仪知识产权案最终以MJ败诉并宣布破产、最终被Bio-rad收购
暂告一段落。其后还会不会有后继的故事还需拭目以待。
PCR原理
DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可
以变性解链成单链,在DNA聚合酶的作用下,以单链为模版,根据碱基互补配对
原则复制成新的单链,与模版配对成为双链分子挎贝。在体外实验中发现,DNA
在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温
度变化控制DNA的变性和复性,并设计与模板DNA的5’端结合的两条引物,加入
DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制,多次重复“变性解链—退火—
合成延伸”的循环就可以以几何级数大量扩增特定的基因。
发现耐热DNA聚合酶对于PCR的应用有里程碑的意义,该类酶可以耐受90℃以上
的高温而不失活,不需要每个循环加酶,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了
成本,PCR技术得以大量应用,并逐步应用于临床。
从PCR原理可以看出,PCR仪的关键是升降温的步骤。现在偶尔还能听到一些前辈
们笑谈
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