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伴x染色体近交系数计算.docx

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伴x染色体近交系数计算

我们先来看一个家系:

计算图中家系中X个体的近交系数,我们按规范的步骤来,应该首先写出连接X双亲S和D的所有通径:S←A→D、S←B→D

(这里我们需要再强调一下通径的书写,通径是以个体和箭头组成的关系链,以箭头表示亲子关系。箭头的方向在一条通径中只能改变一次,改变处的个体即为该通径中的共同祖先。通径的两头连接的是要计算近交系数的个体的双亲。注意通径中不允许出现重复个体)

两条通径中各有三个个体,故X的近交系数为:

Fx=(1/2)3+(1/2)3=1/4

以上的例子最常见的形式,相信大家都已经对这样的计算十分熟悉了,我们再来看一个复杂一些的家系:

计算图中Z个体的近交系数

通过分析我们发现Z的双亲是亲子关系……Z的双亲还是兄妹(或姐弟)关系…Z的外祖母和父亲(或祖父和母亲)又是兄弟姐妹关系……

这一家子挺扑朔迷离的,咱也捯饬不清楚了,我们按照常规方法直接来写通径吧:

S→D、S←A→D、S←I→A→D

写完之后,我们会发现一个神奇的事情:

在第一条通径链S→D中,共同祖先S的双亲I和A是亲子关系,S本身就是由亲子近交产生的,具有1/4的近交系数。那么这个时候,同学们不禁会想,这种情况下共同祖先本身是近交的产物,理应会增大后代Z的近交程度,直接套我们常用的公式计算好像不那么合适。

我们怎么对近交系数进行精确呢?

其实,计算近交系数真正的原本的公式,长下面这个样:

F=Σ【(1/2)n(1+FA)】(FA为每一条通径的共同祖先的近交系数)

由此,我们就可以理解共同祖先是近交个体时,对后代近交系数的影响了。所以说大家也能看出,我们粗略计算使用的公式F=Σ(1/2)N,实际上是默认了所有共同祖先的近交系数都为0的一种特殊情况。

那么我们最后计算出上图中Z的近交系数为:

FZ=(1/2)2(1+1/4)+(1/2)3(1+0)+(1/2)4(1+0)=1/2

希望大家做题时,不要忽视共同祖先本身为近交个体产生的影响。

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