中药资源研究常用生物信息学技术.pdf

20128148ModernChineseMedicineAug.2012Vol.14No.8

年月第卷第期中国现代中药

中药资源研究常用生物信息学技术

1，2232*

，，，

谢腾王升马炯郭兰萍

(1.，610031;

西南交通大学生命科学与工程学院四川成都

2.，100700;

中国中医科学院中药研究所北京

3.，518055)

北京大学深圳研究生院环境与能源学院广东深圳

［］，

摘要生物信息学的兴起和快速发展在全球取得的巨大进展和成就为中药资源研究提供了新的研究方法

，。，

技术和思路并且极大地推动了中药资源的研究和产业发展综述中药资源研究常用的生物信息学技术以期为中

药资源研究提供基础信息和方法。

［］;;

关键词中药资源生物信息学技术综述

(ChineseMedicinalResources)，、、，

中药资源是在通过对这些数据的分类收集整理产生了成千

，

一定空间范围内可供作为中药使用的天然药物及其上万的数据库几乎涉及了生命科学的各个研究领

［1］

蕴藏量的总和，、域，，，

包括植物类资源动物类资源和如核酸序列数据库蛋白质序列数据库蛋白

，。，、、，，

矿物类资源是中药产业发展的物质基础其中质核酸多糖的三维结构数据库基因组数据库

。。

中药植物资源是自然界来源最广泛的中药资源文献数据库和其他种类数据库目前应用比较广泛

，:GenBank、EMBL、DDBJ

作为一门新的交叉学科和工具学科生物信息的数据库有等核酸序列

学技术在揭示中药次生代谢产物的产生、解释道地数据库和PIR、MIPS、Swiss-Prot等蛋白质序列数