微生物分类鉴定.ppt

根据CarlWoese的理论，现在还在界之上使用域(domain)（把全部生物先分为古生菌域、细菌域和真核生物域，域下面再分界。）2）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变)所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。常用的细菌分类学术语：1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的不同分为不同的噬菌型等4）种（species）：物种，生物分类中基本的分类单元和分类等级。高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其他类群的菌株有很明显的区别。菌株与型的区别：菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据，不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型必需有分类学依据。二、微生物的命名例如Bacillussp双名法，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成，一般用斜体表示属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示，二、微生物的命名模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”种和亚种指定模式菌株（typestrain）；亚属和属指定模式种（typespecies）；属以上至目级分类单元指定模式属（typegenus）；第三节、细菌分类鉴定的特征和技术在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料，都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据。形态学特征、生理学特征、生态学特征从不同层次(细胞的、分子的)，用不同学科(化学、物理学、遗传学、免疫学、分子生物学等)的技术方法来研究和比较不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的反映微生物类群特征的资料。生物分类的传统指标：123456一、形态学特征培养特征、运动性、特殊的细胞结构、细胞形态及其染色特性、等等微生物分类和鉴定的重要依据之一：a）易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊形态结构的细菌；b）许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对的稳定性；二、生理生化特征与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关；代谢产物等营养类型；与氧的关系；对温度的适应性；对pH的适应性；对渗透压的适应性；酶及蛋白质都是基因产物；对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较；测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多；三、核酸的碱基组成和分子杂交特点：与形态及生理生化特性的比较不同，对DNA的碱基组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微生物之间基因组的差异，因此结果更加可信。1.DNA的碱基组成(G+Cmol%)DNA碱基因组成是各种生物一个稳定的特征，即使个别添加标题分类学上，用G+C占全部碱基的克分子百分数(G+Cmol%)添加标题基因突变，碱基组成也不会发生明显变化。添加标题来表示各类生物的DNA碱基因组成特征。添加标题第十一章微生物的进化、系统发育和分类鉴定大约46亿年前，地球形成；大约35亿年前，通过“前生命的化学进化”过程千姿百态的生物种类漫长的进化历程地球上开始出现生命，主要是些类似简单杆状细菌的原始生物。进化(evolution)：生物与其生存环境相互作用过程中，其遗传系统随时间发生一系列不可逆的改变，在大多数情况下，导致生物表型改变和对生存环境的相对适应。今天仍生存在地球上的生物种类，彼此之间都有或远或近的历史渊源。最原始的生命漫长的进化历程千姿百态的生物种类12345系统发育(phylogeny)：各类生物进化的历史。分类(classification)：根据生物特性的特征的相似程度将其分群归类。地球上的物种估计大约有150万，其中微生物超过10万种，而且其数目还在不断增