水稻粒长QTL qMGL1的精细定位和两个穗长QTL(qMPL1和qMPL2)的初定位.pdfVIP

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摘要I

ABSTRACTIII

缩略词对照表VI

第一章文献综述1

1水稻粒形性状QTL定位和克隆的研究进展1

1.1水稻数量性状的遗传特征1

1.2粒形基因分子调控机理的研究2

1.2.1泛素蛋白酶体途径-2

1.2.2G蛋白信号途径3

1.2.3丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号途径4

1.2.4植物激素途径5

1.2.5转录因子途径8

1.2.6其他途径9

1.3图位克隆10

1.3.1图位克隆的原理及步骤10

1.3.2构建遗传连锁图谱的群体选择11

1.3.3QTL分析的方法11

1.4BSA混池测序12

2水稻穗形性状QTL的研究进展14

2.1穗形的分类14

2.2调控穗形QTL的研究14

3研究目的和意义15

3.1研究目的15

3.2研究意义15

第二章水稻粒长QTL的精细定位及候选基因分析16

1材料与方法16

1.1研究材料/仪器/试剂16

1.1.1实验材料16

1.1.2材料种植16

1.1.3实验试剂16

1.1.4实验仪器17

i

水稻粒长QTLqMGL1的精细定位和两个穗长QTL(qMPL1和qMPL2)的初定位

1.1.5试剂配制17

1.1.6常用数据库和软件18

1.2实验方法18

1.2.1性状调查18

1.2.2水稻DNA的提取18

1.2.3PCR反应体系及扩增程序20

1.2.4电泳检测21

1.2.5TaqDNA聚合酶的制备21

1.2.6水稻幼穗总RNA的提取23

1.2.7反转录PCR24

1.2.8分子标记的来源与设计24

1.2.9BSA混池测序技术25

1.3QTL定位25

1.4精细定位和候选基因筛选25

1.5克隆目的片段的引物设计26

1.6候选基因的PCR扩增26

1.7目的片段的胶回收27

1.8测序27

2结果与分析27

2.1亲本表型分析27

2.2F群体粒形性状的遗传分析30

2

2.3BSA混池测序分析31

2.4qMGL1的精细定位34

2.4.1qMGL1定位区间的缩小34

2.4.2210.1kb区间候选基因35

2.4.3候选基因的生物信息学分析及其在双亲中的表达水平检测37