科学工作流kepler及其应用.pptVIP

Kepler系统DirectorActorActorActorPortPortTheDirectorcontrolsthesequenceofactorexecution.Eachactortakesdataonitsinputports,processesthatdata,andsendresultsitsoutputports.ComponentTabWorkflowDisplayPanelSearchableComponentListAnactor‘fires’,placingtheresultingdatainacontainercalleda‘token’.Thedatatokenthenflowsfromtheoutputporttotheinputportofconnectedactors.DataTokenDataTokenBeginworkflowexecutionbuttonActorstransforminputtokensintooutputdatatokenswhichthengetpassedtothenextactorundercontrolofthedirector.在用Kepler/PtolemyII构建的科学工作流中，独立处理具体任务的组件实体被称为“actor”。01“actor”之间通信的接口是“port”，有inputport和outputport两种。02actor使用“parameter”来配置和定制相关的行为。03actor之间通过“channel”相互连接。04Kepler系统Kepler系统类型定义良好的面向角色工作流模型Defineaworkflow:

W=A,D,Σ,M,ΦA:asetofActorsD:asetofconnectionsΣ:i/o-signatureofWM:adirector(modelofcomputation)Φ:asetofconstraintsKepler系统“director”指定了模型执行的语义，定义了actor如何执行，以及相互之间如何通信。用户定制好的工作流模型，包括一个特定领域的“director”，以及至少一个“actor”。工作流执行的时候，“director”控制数据在“actor”中的流动，按照定制好的流程，调度部署每个“actor”的迭代执行。科学工作流kepler及其应用周园春、林小光、程洁黄刚、王鹏飞、屈侠2008-10-28背景工作流概述科学工作流系统简介Kepler系统及其应用基于Web的科学工作流目录海量科学数据背景1科学与工程研究日益成为数据密集型的工作。32科学数据规模越来越庞大，科学实验过程也越来越复杂。数字化技术和无处不在的网络发展推动了数据的收集、产生、共享、与分析。超级计算环境背景030201与观察实验、理论分析鼎足而立的科学计算已成为e-Science的核心。现今很多交叉和前沿学科的研究越来越需要高性能计算，如大气科学计算、生命科学计算、湍流计算、分子模拟等。由于这些研究所需的数据资源和计算资源非常庞大，目前各研究机构很难为这些科研需求提供足够的资源，导致了很多研究无法往前推进。背景科学密集型实验迭代的科学数据处理流程01源数据获取Web服务、SRB、FTP、HTTP02数据输入03数据预处理04数据运算05数据分析数据挖掘06结果输出结果数据集可视化图片等07背景动态的科学逻辑处理过程虽然数据密集型科学问题的求解过程也遵循一定的基本流程，但是整个过程中的诸多细节却是动态的、不确定的，科学实验流程的定义往往是不完整的，在执行过程中也需要根据实验流程的运行态势做出动态修改。商业工作流工作流的概念起源于办公自动化领域。它所关注的问题是处理过程的自动化，它根据一系列定义的规则，把文档、信息或任务在参与者之间传递，以达到某种目的。工作流管理联盟（WfMC）对工作流的定义：一类能够完全或者部分自动执行的经营过程，根据一系列过程规则、文档、信息或任务能够在不同的执行者之间传递、执行。工作流概述经营过程的一个计算机实现。工作流管理软件（WfMS）是一个软件系统。用以完成工作流的定义和管理，并按照在计算机中预先定义好的工作流逻辑推进工作流实例的执行。运行在一个或多个工作流引擎上。与工作流执行者交互，推进