纤维素酶类糖苷水解酶及其降解机理.ppt

*纤维小体的多样性根据纤维小体上脚手架蛋白的数量，可以被分为两类:第一类：解纤维梭菌、食纤维梭菌、约氏梭菌、丙酮丁醇梭菌、等嗜温梭菌产生的纤维小体。只发现了Ⅰ型的粘连模块和对接模块。（6~9个）第二类：热纤梭菌、解纤维醋弧菌、黄色瘤胃球菌和溶纤维素拟杆菌。复杂程度高。有限资料表明，纤维小体的组成和分布会受到碳源的影响，另外纤维小体的某些结构蛋白和催化组分基因的表达也受到生长速率的影响。厌氧细菌纤维素酶的结构与功能*纤维小体的多样性厌氧细菌纤维素酶的结构与功能图4.5*纤维小体的多样性厌氧细菌纤维素酶的结构与功能*纤维小体的多样性厌氧细菌纤维素酶的结构与功能*4.4.6纤维小体基因在基因中的分布规律厌氧细菌纤维素酶的结构与功能*4.4.7微型人造小体的研究进展厌氧细菌纤维素酶的结构与功能纤维小体实际上是一个微型而高效的纤维素降解机器。现在已提出了通过理性人工设计并通过工程手段提高天然纤维小体降解活力的新思路。可行性依据：1）对于细菌的粘连模块和对接模块，无论是单独生成还是移植到异源性的蛋白质上，它们都能忠实地保持自身的生物学性质。2）二者高亲和力相互作用在一些产纤维小体的细菌种类之间具有物种专一性。*4.4.7微型人造小体的研究进展厌氧细菌纤维素酶的结构与功能与天然纤维小体相比，有三个主要的不同之处：1）含有酶的数量有限。2）是同源性的。3）每个酶在微型手脚架蛋白上的位置是受到控制的。未来前景包括构建新的杂交手脚架蛋白，使之能够将三个或多个不同的酶结合到特定位点上。嵌合体的稳定性也是影响它将来工业化应用的一个因素。*4.5好氧真菌纤维素酶的结构与功能好氧真菌分泌的纤维素酶分子一般都由一个糖基化的连接肽将一个较大的催化结构域和较小的纤维素结合结构域连接起来构成。*4.5.1催化结构域及催化断键机理好氧真菌纤维素酶的结构与功能纤维素酶催化断键功能相似，但属不同糖苷水解酶家族。T.reesei是纤维素酶体系研究最为深入的好氧真菌。其中CBHI是该菌所产主要的外切酶。催化中葡聚糖异头碳的构型并不发生变化。水解主要产物是纤维二糖。*4.5.1催化结构域及催化断键机理好氧真菌纤维素酶的结构与功能*图4.9好氧真菌纤维素酶的结构与功能*4.5.1催化结构域及催化断键机理好氧真菌纤维素酶的结构与功能有待研究的问题：结晶纤维素表面如何游离出单根葡聚糖分子链。单根葡聚糖链如何快速准确地进入CBH的催化孔道中。葡聚糖链如何在催化孔道中高效地持续性单方向运动。*纤维素酶类糖苷水解酶及其降解机理第四章*4.1导言纤维素类生物质是自然界中最丰富的。与淀粉在结构上的差别仅在于糖苷键连接方式不同。多与半纤维素、木素相互结合在一起。纤维素酶系统非复合：真菌、放线菌一般由菌丝分泌到胞外分别发挥作用。复合：厌氧菌（热纤梭菌）在其细胞壁上产生隆起的细胞结构，为纤维小体。导言自从1906年在蜗牛消化液中首次发现纤维素酶后，人类对其研究经历了百年历史：1950--木酶的发现，C1-Cx假说。1980年至1988年--利用基因工程的方法对纤维素酶的基因进行克隆和一级结构的测定。90年代--厌氧细菌纤维小体超分子复合体结构功能研究，多结构与体系的发现。21世纪--基因及氨基酸序列，分子时代。4.2纤维素酶系统的组成根据各酶的功能可分为三大类：内切葡聚糖酶（endo-1,4-β-Dglucanase,EC.3.2.1.4,来自真菌的简称EG，来自细菌的简称Cen）,这类酶作用于纤维素分子内部的非结晶区，随机水解β-1，4-糖苷键,将长链纤维分子截断,产生大量非还原性末端的小分子纤维素。外切葡聚糖酶(exo-1，4-β-D-glucanase，，又称纤维二糖水解酶，来自真菌简称CBH，来自细菌简称Cex。）这类酶作用于纤维素分子的非还原端,依次水解β-1,4-糖苷键,每次切下一个纤维二糖分子。124.2纤维素酶系统的组成β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,EC.3.2.1.21,简称BG）,这类酶水解纤维二糖和短链的纤维寡糖生成葡萄糖。对纤维二糖和纤维三糖的水解很快，随着葡萄糖聚合度的增加水解速度下降。4.3糖苷水解酶家族以底物专一性为基础建立的命名方法不能反映酶分子的结构特性。把作用于碳水化合物的相关酶类分成许多蛋白质家族，形成专门的数据库共享。碳水化合物活性酶(CAZy)分类系统，只对结构域进行定义。CAZy中某一基因的结构域以模块表