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基本原理SDS碱裂解结构差别分子量差别变性-复性一、质粒DNA的提取流程碱裂解Ⅱ碱变性接含pETBlue-2(质粒的单菌落于4mLLB羧苄(50ug/mL)和四环素(12.5ug/mL)液体培养基中?370C,190rpm振荡培养过夜?4000rpm、离心1min,收集所有菌体?150uL溶液I悬浮菌体(旋涡混匀),室温10min?加入200uL溶液II(轻轻混匀!),室温静置菌液裂解变清接菌培养收菌碱裂解Ⅰ?加入200uL溶液III(轻轻混匀!),冰上静置15min质粒DNA复性?12000rpm,离心10min?上清加等体积的酚:氯仿:异戊醇(旋涡混匀)?12000rpm,离心5min?上清加等体积的氯仿:异戊醇(旋涡混匀)?12000rpm,离心5min?复性回收纯化上清加2倍体积的无水乙醇(旋涡混匀),室温30min?12000rpm,离心10min?沉淀用75%乙醇1mL洗涤两次(振荡混匀、离心)?12000rpm,离心5min?沉淀于超净台中风干(5min~20min)?沉淀加入20uLRTE,600C水浴30分钟溶解?-200C保存醇沉回收溶解保存离心标识碱裂解Ⅰ溶液Ⅰ冰浴pH8.0剧烈振荡10min溶液粘稠混浊碱裂解Ⅱ!!溶液Ⅱ现用现配切勿振荡!颠倒混匀T≤5minSDS包被复性回收!!溶液Ⅲ冰上预冷切勿振荡!颠倒混匀15min仅质粒复性?在哪相?二、质粒DNA的电泳制胶:1%琼脂糖(20mL,1xTAE)缓冲液:1xTAE,130mL制样:质粒DNA2μL
10xloading0.5μLMarker:5μL电泳:80伏恒压结果分析:鉴定(定性,纯度);半定量QA关于PCR结果分析
关于产物回收
①漂洗作用:换缓冲液,除杂
②乙醇:保存目的产物
③离心:去乙醇,除液体,保证后续工作④补救:勿轻易弃置;
高盐结合,重复漂洗。
关于…………123456M789101112Fig.1AgaroseElectrophoresisanalysisofthePCRproducts.Lane1~Lane12:productsofPCR
M:DNAmarker(fromtoptobottom:2000bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp)引物或其二聚体问题:①10泳道:上样错位?错误模板?引入污染?热启动不够?回收,重新电泳鉴定。②1、12泳道:未加引物或模板。相邻泳道溢出污染非特异性!Good!!PCR仪中的
位置边缘效应?!胶融!胶融!外溢质粒DNA的提取
及其定性定量分析基因的克隆与表达专题之二主要内容一、质粒DNA提取二、琼脂糖电泳鉴定及半定量三、紫外吸收定量及纯度检测
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