宏基因组功能基因筛选.pptxVIP

宏基因组功能基因的筛选;目录;宏基因组（Metagenome）;;目录;MetagenomicsinvolvesconstructingDNAlibrariesfromenvironmentalDNA;;;通过设计特异的PCR引物，扩增得到V3或V6区的序列，然后两端加上接头，便可利用Illumilla的高通量测序技术对V3或V6区进行测序分析，以获得环境样品中细菌等物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化、群落比较等诸多信息。;真菌ITS的高通量测序分析;;宏基因组文库

MetagenomicLibrary;基于宏基因组分离筛选功能基因

的四个技术要素

载体Vector

宿主Host

自然产品筛选平台

NaturalProductDiscoveryPlatform

环境样品DNA制备DNAPreparation

高通量筛选

HighThroughputScreening;原位裂解法：将土壤样品直接悬浮在裂解缓冲液中处理,继而抽提纯化。

此法操作容易、成本低、DNA提取率高、偏差小,但由于强烈的机械剪切作用,所提取的DNA片段较小(1-50kb)，且腐殖酸类物质也难以完全去除。;一般选用质粒、粘粒或者Fosmid载体来构建文库，其插入片断小于40kb,对生物合成比较复杂的化合物，因其基因簇较大，则无法完整克隆。;宿主;;如可在各种