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2025-02-12 发布于北京
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基因启动子序列的查找.ppt

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基因启动子序列的查找一、基因序列查找NCBI—选择“Gene”—输入基因的名字（eg.p53）--Search基因序列查找选择特定物种的p53基因—eg.TP53(human)基因序列查找获得TP53基因的详细信息：基因名称、全称、别名、类型等。下拉获得更多详细信息基因序列查找基因组结构：不同版本中，此基因在染色体中的位置、转录方向等。基因序列查找基因组区域，转录，产出：p53基因在不同转录本中的信息—点击GenBankGenBank:获得基因详细信息：位置、定义、登录号、版本、特征、碱基序列等。基因序列查找FASTA:获得基因的全部序列（包括非转录区序列）。启动子序列的查找在NCBI中查找所需的基因（以p53为例）查找P53的基因序列；启动子序列的查找在NCBI中查找所需的基因（以p53为例）选择特定物种的P53基因，例如human.启动子序列的查找在NCBI中查找所需的基因（以p53为例）获得humanp53基因的详细信息01在染色体上的位置：Chromosome17-NC_000017.11添加标题02转录方向：从右向左，反向转录，说明启动子区与第一外显子区位于此段基因的右侧。添加标题启动子序列的查找2、确定此基因在染色体上的位置和转录方向（正向/反向）；启动子序列的查找确定启动子区与第一外显子区的长度；获得FASTA格式的序列信息，右侧为此段基因的长度：7668402-7687550bp.启动子区位于基因5’端2000bp，即7687550-7689550bp启动子序列的查找确定启动子区与第一外显子区的长度；查找第一外显子的位置：在p53基因的详细信息页面中查找mRNA的详细信息，确定其在基因序列中的位置。启动子序列的查找确定启动子区与第一外显子区的长度；进入P53基因mRNA的详细信息界面启动子序列的查找确定启动子区与第一外显子区的长度；进入P53基因mRNA的详细信息界面，找到exon（第一外显子）的位置：1-174bp