2025定向纳米孔病原学测序技术在器官移植感染防治中应用的多中心专家共识.pdf

2025定向纳米孔病原学测序技术在器官移植感染防治中应用的多中心专

家共识

器官移植是终末期器官疾病的重要治疗手段，术后感染问题是影响患者预

后的重要因素[1]。传统的基千病原分离培养、免疫学检测、分子生物学检

测等的感染诊断方法在灵敏度、特异性、检测速度等方面存在一定局限性，

难以满足临床精准防治的需求。随着基因组学技术的发展，高通晕测序技

术弥补了传统技术的不足，现已发展至第二代和第三代，其中第三代测序

技术因其超长测序读长逐渐被应用千临床各个领域，它又分为定向、宏基

因组、全基因组测序等方向，依据测序原理分为纳米孔和单分子荧光信号

测序。其中的定向纳米孔病原学测序（以下简称“纳米孔测序”)技术以

其独特优势，为提升器官移植术后感染诊断及防治水平提供了条件[2-5]。

为了让纳米孔测序技术在器官移植术后感染防治中规范化应用，特制定了

“定向纳米孔病原学测序技术在器官移植感染防治中应用的多中心专家

共识”，为其临床推广与合理使用提供指导。

1纳米孔测序技术的原理与特点

1.1原理

纳米孔测序技术无需对样本进行扩增，而是将DNA分子单链化，并在驱

动酶的帮助下逐个通过纳米孔。纳米孔中的离子流被通过的碱基阻断，不

同碱基引起的电信号被实时记录，从而可以通过特定算法将电流信号翻译

成相应的碱基序列，实现从样本处理到数据生成的实时分析。

1.2特点

1.2.1读长优势

DNARNA

纳米孔测序技术能够在单次运行中可以读取超长的或分子序列，

有助千复杂基因组区域的分析及病原体全基因组测序，对千鉴定病原体亚

型、追踪感染源及研究病原体进化具有重要意义，可减少因短读长拼接导

致的误差和信息丢失[6]。

1.2.2在结构变异检测中的优势

纳米孔测序技术的核心优势之一是其超长读长能力，能够生成长度达数万

甚至数十万碱基的连续序列，其超长读长能力这一特点在基因组结构变异

的检测中具有显著优势。＠相比第二代测序的短读长，第三代测序纳米

孔测序技术的长读长在识别复杂区域如重复序列、串联重复、大片段插入

或缺失以及染色体重排中尤为突出[6]。在临床应用中，对下呼吸道感染患

者的病原体进行基因组分析时，长读长不仅可以稍准识别耐药基因的插入

或移动元件的存在，还能解析病原体基因组的重组或进化过程。＠长读

长对检测与病原体毒力或抗性相关的大型结构变异（如毒力岛或抗性岛）

具有天然优势，从而为复杂感染的诊断和个体化治疗提供了重要依据[7-8]。

＠还可以避免因短读长无法覆盖重复区域或跨变异区域的局限，从而显

著降低假阴性率，并提高检测的灵敏度和特异性。这使得第三代测序纳米

孔测序技术成为包括罕见病致病基因检测和复杂微生物群体结构解析在

内的诸多领域的理想选择。

1.2.3快速、灵活适应临床需求

相比千第二代测序，第三代测序纳米孔测序技术凭借实时数据生成和无需

扩增的特点，通过直接读取单分子核酸链，可以实现从样本处理到数据生

成的实时分析，可在数小时内完成病原体检测并在短时间内得到初步结果，

有效缩短了从采样到报告的时间窗口，满足临床急性需求；可根据临床需

求调整测序深度和终点，实现快速诊断与精细分析的平衡，极大地支持个

体化精准医疗[7]；它适用千多种样本类型（如血液、痰液等），操作灵活，

尤其在器官移植术后抢救性治疗或复杂或多重感染的检测中优势显著，可

快速识别病原体，从而及时指导抗感染治疗[7-10]。

2纳米孔测序技术的临床应用建议

2.1术前评估

2.1.1供者器官检测

由于供者体内的巨细胞病毒、Epstein-Barr病霉、人类免疫缺陷病霉、

乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒，特异性感染中的狂犬病病毒、破伤风梭菌、