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蛋白质的计算设计与结构预测

目录

蛋白质的计算设计与结构预测（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1蛋白质计算设计与结构预测的背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.2蛋白质计算设计与结构预测的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.3文档概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

蛋白质结构基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.1蛋白质的一级结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.2蛋白质的二级结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.3蛋白质的三级结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.4蛋白质的四级结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

蛋白质计算设计与结构预测方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

3.1基于物理化学的方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.1.1分子动力学模拟．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

3.1.2群论方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

3.2基于统计力学的方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

3.2.1知识库驱动的预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

3.2.2序列比对与折叠识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

3.3基于机器学习的方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

3.3.1隐马尔可夫模型．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.3.2支持向量机．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

3.3.3深度学习．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

蛋白质结构预测工具与软件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

4.1在线预测工具．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

4.2离线预测软件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

蛋白质计算设计与结构预测的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

5.1蛋白质功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

5.2蛋白质结构优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

5.3蛋白质-蛋白质相互作用研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

5.4蛋白质工程与药物设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

蛋白质计算设计与结构预测的挑战与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

6.1预测精度与效率的平衡．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

6.2数据与算法的整合．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

6.3新兴技术的发展与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

6.4跨学科合作与人才培养．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

蛋白质的计算设计与结构预测（2）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

1.2蛋白质研究的现状和发展趋势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

蛋白质的结构基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．