生物化学-第十章-RNA的生物合成.pptVIP

第十章RNA的生物合成;第一节DNA指导的RNA的合成;一、转录的一般特点;;〔一〕原核生物RNA聚合酶?;核心酶coreenzyme;亚基;多个通道：核苷酸入口；RNA出口；DNA入口;〔二〕真核生物的RNA聚合酶

功能分工;转录起始需解决两个问题：

RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。

DNA双链解开，使其中的一条链作为转录的模板。;DNA序列按正链RNA来书写。将在DNA上开始转录的第一个碱基定为+1，沿转录方向下游的核苷酸序列均用正值表示；上游的核苷酸序列均用负值表示。;;ThenucleotidesequencesofrepresentativeE.colipromoters;如何确定启动子的位置和序列？;σ因子识别并与启动子特异性结合〔上游序列由α亚基识别〕;1〕RNA聚合酶与dsDNA非特异结合〔疏松〕，滑动扫描

2〕RNA聚合酶全酶与启动子-35区特异结合，形成封闭复合物〔未解链〕

3〕封闭复合物异构化，转变为开放复合物〔解链形成转录泡〕

4〕第一个磷酸二酯键形成〔通常为嘌呤核苷酸〕

5〕启动子清空〔参入6-10nt后σ因子释放，RNA聚合酶离开〕;RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合;σ因子识别并与启动子特异性结合〔上游序列由α亚基识别〕;当s因子从核心酶上脱落后，核心酶与DNA链的结合变得疏松，可以在模板链上滑动，方向为DNA模板链的3′→5′，同时将核苷酸逐个加到RNA链的3-OH端，使RNA链以5′→3′方向延伸。;;终止子：DNA分子上终止转录的特殊信号。

原核生物终止子都有一个回文序列，产生的RNA可形成茎环结构，可使RNA聚合酶减慢移动或暂停合成。

NusA等因子：辅助RNA聚合酶识别终止子。

如NusA因子促进其在终止子位置的停顿。

;1.依赖?因子的转录终止〔当终止信号较弱时〕;;转录方向;

;起始;真核细胞的转录比较复杂。

1.真核基因的顺式作用元件〔cis-actingelement〕：

即DNA上对基因表达有调节活性的特定序列，

按其功能可分为：启动子、增强子〔enhancer〕和沉默子〔silencer〕等。

对应三类RNA聚合酶，有三类启动子，RNA聚合酶Ⅱ的启动子序列多样。;TATA盒;TATA框是RNA聚合酶Ⅱ和转录因子形成前起始复合物的主要装配点。

起始子〔initiator，Inr〕：转录起点;2.转录因子〔transcriptionfactor，TF〕：

RNA??合酶在启动子部位起始转录需要的辅助因子〔蛋白质〕。

真核生物的转录，启动子由转录因子而不是RNA聚合酶识别。

参与RNA聚合酶Ⅱ转录起始的转录因子数目众多，分为三类：通用转录因子〔generaltranscriptionfactor，GTF〕、上游因子、可诱导因子。;参与RNA-polⅡ转录的TFⅡ;POL-Ⅱ;原核生物与真核生物转录的区别;;第二节转录后加工;⑴真核细胞每种转录产物都是各种RNA的前身，必须在胞核内经过适当加工，使之变成具有活性的成熟RNA后，由胞核运至胞质才能执行翻译功能。

⑵原核细胞mRNA不需加工，tRNA和rRNA需要加工。

⑶mRNA前体加工复杂。真核细胞转录作用和翻译作用无论在空间上还是时间上都是彼此分开进行的。

;一、原核生物RNA的转录后加工;〔1〕多数为多顺反子;5’成熟酶;P572;〔1〕RNaseP切除E.coli前体tRNA5′的前导序列〔41nt〕。

〔2〕去尾，形成3’-OH末端。由内切酶和外切酶〔RNaseF和RNaseD〕共同参与。;碱基修饰;原核生物rRNA以多顺反子的形式存在，还可能带有某些tRNA的基因。

E.coli中rRNA有7个转录单位,每个转录单位含有16S、23S、5SrRNA及一个或几个tRNA。rRNA前体的加工由RNaseⅢ等负责。;1.剪切和修剪

2.核苷酸的修饰〔主要为核糖的甲基化，SAM作为供体〕;二、真核生物RNA的转录后加工;图5-9帽子p161;〔2〕帽子的功能

提高mRNA的稳定性；参与识别起始密码子；有利于mRNA从核到质的转移；5‘帽子结合蛋白涉及第一个内含子剪接复合物的形成，直接影响mRNA的剪接效率;2.3′加尾;Eukaryotepre-mRNAsoftenhaveinterveningintronsthatmustberemovedduringRNAprocessing

intron=non-codingDNAsequencesbetweenexonsinagene.

exon=expressedDNAsequencesinag