真核生物的基因表达及其调控G.pptVIP

HTH是第一个被确立的DNA-结合结构。很多细菌的调节蛋白是以螺旋转角螺旋这种基序存在，如Lac阻遏蛋白,Trp阻遏蛋白、分解代谢激活蛋白(CAP),l噬菌体阻遏蛋白（Cro）,噬菌体434阻遏蛋白。在酵母中涉及交配型的a1和a2蛋白以及在高等真核生物中的Oct-1和Oct-2蛋白也属于此类型。这种基序包含有两个a螺旋，螺旋之间间隔有一个短的b转角，使两个螺旋可通过疏水作用装配起来。第一个螺旋稳定并使第二个螺旋暴露出来，与DNA的大沟作用，而特异性地与碱基接触。因此，第二个螺旋被称为识别螺旋(recognitionhelix)。上述的相互作用锚定了蛋白质中识别螺旋的位置并稳定了DNA的构象，从而调节不同蛋白和其结合位点的亲和力。homeodomain与DNA结合基序包含有两个a螺旋，螺旋之间间隔有一个短的b转角，使两个螺旋可通过疏水作用装配起来。第一个螺旋稳定并使第二个螺旋暴露出来，与DNA的大沟作用，而特异性地与碱基接触。因此，第二个螺旋被称为识别螺旋(recognitionhelix)。上述的相互作用锚定了蛋白质中识别螺旋的位置并稳定了DNA的构象，从而调节不同蛋白和其结合位点的亲和力。HTHmotif与DNA结合名称来源于它的结构，它由一小组保守的氨基酸和锌离子结合，在蛋白质中形成了相对独立的功能域，像一根根手指伸向DNA的大沟。两种类型的DNA结合蛋白具有这种结构，一类是锌指蛋白，另一类是甾类受体。典型的锌指蛋白有一组锌指，单个的锌指的保守序列是：Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X2-His,根据锌结合位点的氨基酸又把锌指分成为2Cys/2His和2cys/2cys两类，前者为Ⅰ型，后者为Ⅱ型锌指。ⅱ）锌指fingerC2H2Zincfinger与DNA结合zincfinger往往有2-13个串联在一起。loop与DNA的大沟结合。iii）basicleucinezipper（bZIP）4个leucine被7个氨基酸分隔着。两侧有碱性氨基酸。01zipper与其相邻的螺旋构成一个“scissor”。03这个富含leucine的螺旋中，4个leucine恰好都突出在同一个侧面上。05两个这样的螺旋组成的二聚体中，两排leucine像一个“zipper”。02Scissor的两片“刀”与DNA结合。04zipper单击此处可添加副标题两个蛋白之间相互作用共同建立一个转录复合体，在一系列转录因子中发现的一种基序涉及两个相同和不同的部分构成。亮氨酸拉链是一种富含亮氨酸的蛋白链形成的二聚体基序。它本身形成二聚体同时还可以识别特殊的DNA序列。一个亲水的α-螺旋在其表面的一侧有疏水基因（包括亮氨酸），另一侧表面带有电荷。亮氨酸拉链蛋白通过疏水界面上的亮氨酸形成二聚体。在肽链上两Leu之间相隔7个氨酸，这样使它们在α-螺旋中排列成一条直线。亮氨酸拉链的侧翼是DNA结合功能区,含有很多的Lys和Arg。二聚体的形成对于DNA的结合是必要的。很多原癌基因，例如c-jun和c-fos都编码亮氨酸拉链蛋白，它们本身相互作用，形成同二聚体（homodimers）或异二聚体（heterodimers）。C-Jun和C-Fos蛋白的异二聚体的结合比它们同二聚体更为牢固。Myc，C/EBP（结合CAATbox和SV40核心增强子的一种因子），AP1蛋白（异二聚体，结合于SV40的增强子）等都具有亮氨酸拉链结构。过去认为二聚体之间亮氨酸与亮氨酸是交错连接，像“拉链”一样。而现在认为亮氨酸与亮氨酸是相对连接的。单击此处添加大标题内容ⅳ）螺旋-环-螺旋（helix-loop-helix,HLH）

螺旋-环-螺旋蛋白的基序：有一条含有两个亲水的α-螺旋,链长为40~50氨基酸，两个α-螺旋由很长的连接区（环）相连，螺旋的一侧有疏水氨基酸，两条链依赖疏水氨基酸的相互作用形成同二聚体或异二聚体，此螺旋区长约15~16氨基酸，含有各种保守的残基，连接环的长度不等，一般为12~28氨基酸。与DNA结合的是碱性区，长为15氨基酸，其中有6氨基酸为碱性。在HLH中带有碱性区的肽链称为碱性HLH（bHLH，protein）。bHLH又分为两类。A类是可以广泛表达的蛋白，包括哺乳动物的E12/E47（可和免疫球蛋基因增强子中的元件结合）和果蝇da（daughterless,性别控制的总开关基因）的产物；B类是组织特异性表达的蛋白，包括哺乳动物的MyoD(肌浆蛋白（myogen）基因的转录因子)和果蝇的AC-S（achaete-scute无刚毛基因的产物）这种bHLH可能是一种转录调控蛋白，大部分以异二聚体形式存在。ⅴ