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ICS65.020.30
B41
备案号:
DB32
江苏省地方标准DB32/T1775—2011
I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR方法MethodofRT-PCRdetectingDuckVirusHepatitisI
2011-05-06发布2011-07-06实施
江苏省质量技术监督局发布
I
DB32/T1775—2011
前言
为规范I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术,提高鸭肝炎病毒检测的灵敏度、稳定性、特异性,特制定本标准。
本标准按GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准结构和编写》编制。
本标准的附录A为规范性附录。
本标准由江苏省农业科学院提出。
本标准起草单位:江苏省农业科学院。
本标准起草人:魏雪涛、李银、刘宇卓、张敬峰。
1
DB32/T1775—2011
I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR方法
1范围
本标准规范了I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物大小、所涉及的样品范围、操作流程、反应条件等技术标准。
本标准适用于检测鸭肝脏和病毒尿囊液中I型鸭肝炎病毒核酸。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的,凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样
3方法原理
聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。PCR技术却以其快速、敏感和特异等优点在动物疫病检测中得到广泛应用,而且随着PCR技术的不断改进,这种针对病原核酸的诊断方法表现出更准确、灵敏和特异的特点。本标准选取了DHVIVP1基因的保守,设计了一对特异性引物,经过了PCR条件的优化、特异性实验、敏感性试验等,对DHVI的鉴定具有很高的准确性。
4仪器设备和主要试剂
4.1仪器设备:PCR仪,离心机,电泳槽,微量移液器,凝胶成像系统
4.2主要试剂:TRIZOL,氯仿,异丙醇,无水乙醇,焦碳酸二乙酯(DEPC)处理的灭菌双蒸水,AMV反转录酶,5×AMVBuffer,10mmol/LdNTPs,RNA酶抑制剂,25mmol/LMgCl2,EXTaqDNA聚合酶,10×EXTaqDNA聚合酶buffer,2.5mmol/LdNTP,DNAMarkerDL-2000,琼脂糖。
5引物
上游引物:5′-ATCTAATGTCCCGATACAAGGTG-3′;下游引物:5′-ACGCTAGTGTTTTGAGTCTAAGGC-3′。
6样品采集
按照NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样方法,病死或扑杀鸭,无菌采集肝脏组织。
7方法步骤
2
DB32/T1775—2011
试验用水:按照GB-T6682-2008三级水标准7.1样品处理
取病料0.5g~1g置研钵中剪碎并研磨,反复冻融研磨,将研磨好的组织,用生理盐水1︰5稀释,以4℃12000r/min离心10min,取上清200μL备用。
阴性对照:没有发病的正常鸭肝脏
阳性对照:用中和试验检测DHV阳性肝脏样品(见附录A)7.2DHVRNA的提取
取已处理的待检样品,以DHV阳性病毒为阳性对照,以正常肝脏作为阴性对照,无菌水为空白对照,每管依次加入Trizol600μL,振荡混匀后,室温放置10min,加入氯仿200μL,剧烈振荡后,室温放置1min,4℃12000r/min,离心15min,取上层水相750μL,加入500μL异丙醇,混匀,﹣20℃放置15min,4℃12000r/min,离心15min,去上清,缓缓加入75%乙醇1mL洗涤,4℃8000r/min离心5min,去上清,室温干燥RNA样品沉淀20min,加入DEPC水10μL,使充分溶解。
7.3RT-PCR
反转录反应:5×AMVBuffer4μL、10mmol/LdNTPs2μL、下游引物1μL、RNA酶抑制剂0.5μL、RNA模板10μL,AMV反转录酶0.5μL,H2O(DEPC处理)2μL,总体积为20μL,瞬间离心混匀,65℃
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