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Flowjo高能插件1|ElastiGate——AI矫正圈门位置
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师弟:师姐师姐,老板说我这个流式圈门不对,我都是统一批量圈门的咋就不对了呢?
未刺激组:
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刺激组:
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师姐:师弟,你看你这群细胞,明明有明显分群,但是门的位置把细胞群截断了。
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师弟:师姐,那这只能挨个手动调整门的位置了么?我的样本有几十只小鼠,好几个组织,怕是要通宵达旦吧?而且有
些细胞群分群没那么明显,左移一点右移一点差得有点多。
师姐:师弟,不要怕,师姐最近用了Flowjo的新插件EG(ElastiGate),让AI帮你来干活,哪里还需要你一个个
手动调整。
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师弟:师姐,啥?啥好东西,快来教教我~
师姐:你看,只要画对一个样本,ElastiGate就会根据算法解析你选择的流式图里的细胞数据点分类,然后再结合你设
置的门,矫正分类,最终得到契合每个样本情况的优化设门。
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师弟:这么神奇,AI果真厉害,这个插件怎么安装?怎么使用啊?
师姐:ElastiGate的操作也非常简单。首先需要下载ElastiGate插件:https///exchange/#/,
解压文件,最后找到
1.FlowJo10.10.0的plugins的文件夹;
2.将解压后的.jar格式的文件放入FlowJo10.10.0的plugins的文件夹中。
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师姐:重启FlowJo,先画好一个样本的门,可以先批量处理位置相对固定的前面几级的门,对因实验变量导致群体细
胞上蛋白表达丰度变化的群体进行ElastiGate处理。
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师姐:选择Algorithms里的Plugins下的ElastiGate键。在弹出的ElastiGate窗口
1.选择已圈好门的参考样本;
2.选择需要画门的其他样本;
3.选择需要优化的门;
4.点Start开始运行,
5.等待运行条100%完成;
6.Cancel关闭界面。
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