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甘薯WRKY基因家族序列的分离与鉴定
摘要:根据WRKY基因家族序列的保守区域设计简并引物,从甘薯(Ipomoea
batatasL.)品种徐薯18中扩增出WRKY基因家族,经克隆、测序后得到15条
WRKY基因家族序列,其编码的氨基酸序列包含有WRKY基因家族所具有保守
的WRKYGQ和YEGKH(T/N/S/G/A/D)(H/Q)区。对甘薯WRKY基因家
族氨基酸序列与部分植物WRKY基因家族氨基酸序列进行聚类分析,发现其聚
为5类,相似性较高,推测各类中相似性较高的序列分别属于同一个基因家族。
关键词:甘薯(IpomoeabatatasL.);WRKY基因家族;简并引物;分离;
鉴定
IsolationandIdentificationofWRKYGeneFamilyfromSweetPotato
bstract:Thedegenerateprimersdesignedfromtheconservedmotifsinthe
WRKYgenefamilywereusedtoamplifyWRKYgenefamilyfromIpomoeabatatas,
Xushu18.15WRKYgenefamilywereobtainedaccordingtocloningand
sequencing,andtheaminoacidsequencecontainedWRKYGQandYEGKH
(T/N/S/G/A/D)(H/Q)motifsoftheWRKY.Clusteranalysisofthepredictedamino
acidsequencesgroupedtheWRKYofIpomoeabatatasandtheknownWRKYin
NCBIdatabaseintofiveclasses,andthesequencesimilaritywashigh.Itwas
deducedthattheRGAswithhighsimilaritybelongedtoonegenefamily.
Keywords:sweetpotato(IpomoeabatatasL.);WRKYgenefamily;
degenerateprimers;isolation;identification
甘薯(IpomoeabatatasL.)是世界上重要的粮食、饲料、工业原料及新型能
源用块根作物。中国是世界上最大的甘薯生产国,常年种植面积550万hm2,鲜
薯产量约1.2×108t,分别占世界甘薯种植总面积和总产量的60%和85%[1]。甘
薯在遗传上高度杂合,种内、种间杂交不亲和、遗传资源匮乏,遗传基础狭窄以
及病虫害、病毒病危害严重,严重制约了甘薯品种的遗传改良[2]。近年来,许
多研究表明通过基因工程手段能够改善甘薯的抗病和抗逆能力[3-6]。WRKY转
录因子是近年来在植物中发现的一类锌指型转录因子基因家族,其序列的N-端
含有高度保守的WRKYGQ氨基酸序列。WRKY转录因子能够与C/GACC/
序列(W-box)发生特异性结合,从而调节基因的表达[7]。WRKY转录因子广
泛参与植物对生物和非生物胁迫应答反应,包括对根结线虫、真菌、病毒、NaCl、
PEG、低温、高温、机械刺激以及低磷等逆境胁迫因子的响应[8-20]。另外,也
有研究表明WRKY基因家族参与激素的信号转导过程,如白菜型油菜中的
WRKY基因受ABA诱导[21]。
本研究基于WRKY转录因子的保守区域设计简并引物,PCR扩增获得15
条甘薯WRKY类转录因子基因片段,均含有WRKY转录因子的保守结构域,
然后将其导入甘薯栽培种中,为提高甘薯抗病抗逆性奠定基础。
1材料与方法
1.1材料
试验材料为
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