T_SDAA 0085-2024 畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性评价规程.docxVIP

ICS65.020B43

团体标准

T/SDAA0085－2024

畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性评价规程

2024－10－22发布2024－11－21实施

山东省畜牧协会发布

T/SDAA0085－2024

前言

本文件按照GB/T1.1—2021《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。

请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件由山东省畜牧协会提出并归口。

本文件起草单位：山东省农业科学院畜牧兽医研究所，中英噬菌体工程联合实验室，瑞普高科（天津）生物技术有限公司、瑞科盟生物工程有限公司。

本文件主要起草人：刘玉庆、胡明、张庆、陈义宝、赵效南、李璐璐、吕强华、刘正洁、赵敏、ThomasSicheritz-Ponten、MarthaClokie、刘爱玲、王友、李培勇、刘长太、吴赞锋、任慧英、孙虎芝、李克鑫、崔万超、赵成新、刘晓。

本文件为首次发布。

T/SDAA0085－2024

畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性评价规程

1范围

本文件规定了畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性评价的评价程序、评价内容、综合判定和实验室生物安全。

本文件适用于畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性评价。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，仅该日期的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。

GB4789.2食品安全国家标准食品微生物学检验菌落总数测定GB/T4789.3食品安全国家标准食品微生物学检验大肠菌群计数

GB/T6682分析实验室用水国家标准GB/T13091饲料中沙门菌的测定

GB19489实验室生物安全通用要求

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。3.1

宿主菌hostbacteria

致病性大肠杆菌和沙门菌。3.2

裂解性噬菌体lyticphage

在短时间内能连续完成吸附、侵入、复制、装配和裂解五个阶段而实现增殖的噬菌体，其基因组不整合入宿主菌的基因组。

3.3

裂解谱phagelysisspectrum

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裂解性噬菌体在一定浓度范围专一裂解致病性大肠杆菌或沙门菌，而不裂解益生菌或其它菌种。

3.4

噬菌体环境改良phageenvironmentimprovement

裂解性噬菌体可以感染特定环境中特异性致病菌，通过寄生在致病性细菌体内进行复制增殖，抑制细菌，对环境起到改良作用。

5评价程序

畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性评价

裂解谱/裂解率特异性宿主菌残留杂菌计数

裂解谱/裂解率

特异性

宿主菌残留

杂菌计数

基因组安全特征

综合判定

6评价内容

6.1特异性

按附录A的规定执行。

6.2基因组安全特征

6.2.1基因组提取

按噬菌体基因组（DNA或RNA）提取试剂盒要求提取噬菌体基因组。

6.2.2测序与拼接

将提取的噬菌体基因组送测序公司进行二代测序，并利用Newblersoftware软件进行拼接。

6.2.3基因注释

使用RAST、Prokka软件对基因组进行详细注释。

6.2.4基因组比对

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使用CARD、VFDB、Phaster软件比对有无已知的毒素基因、抗药性基因、整合酶基因和其它可能存在潜在危害的基因。

6.3裂解谱/裂解率

按附录B的规定执行。

6.4宿主菌残留

6.4.1宿主菌为大肠杆菌时，按照国标GB/T4789.3的规定执行。

6.4.2宿主菌株为沙门菌时，按照国标GB/T13091的规定执行。

6.5杂菌计数

按照GB4789.2规定执行。

7综合判定

经检测全部满足：为裂解性噬菌体，且无已知的毒素基因、抗药性基因、整合酶基因和其它可能存在潜在危害的基因；特异性宿主菌为大肠杆菌或沙门菌；对致病性大肠杆菌或沙门菌具有较广裂解谱，不裂解益生菌；无宿主菌残留；无杂菌污染。满足上述所有条件判定为畜禽大肠杆菌和沙门菌噬菌体环境改良安全性合格。

8实验室生物安全

开展细菌与噬菌体安全性检测的实验室管理应符合GB4789.1、GB19489生物安全要求；废弃物处理按照GB19489规定执行；细菌和噬菌体管理按照《动物病原微生物菌(毒)种保藏办理办法》