酶的作用机制和酶的调节.pptVIP

*第七章酶的作用机制和酶的调节具有柔性或可运动性.只占酶分子总体积相当小的部分(1%-2%);是一个三维实体;通过诱导契合的动态过程形成;是位于酶分子表面的一个裂缝内(疏水区域),底物有效浓度高;底物通过次级键较弱地力结合到酶上;030405060102酶活性部位的特点第一节酶作用的机制二.酶催化反应的独特性质1.酶反应大部分反应涉及电子和质子或其他基团的转移(速率108s-1),另有反应仅涉及电子的转移(速率103s-1);2.酶的催化作用是由氨基酸侧链上的功能基团和辅酶为媒介的,主要的是His,Ser,Cys,Lys,Glu,Asp的侧链直接参加反应;3.酶催化反应的最适pH范围通常很狭小;4.与底物相比,酶分子很大;5.生物酶特有的有利条件,使上述反应进行更有利:(1)活性部位存在一个以上的催化基团,可进行协同催化;(2)存在结合部位,底物分子结合在活性部位附近;(3)存在一个以上的底物分子结合部位,可催化多底物反应;(4)底物与酶结合,使底物分子中的键产生张力,有利于过度态复合物的形成.三.与酶催化高效率有关的因素(一)底物和酶的临近效应和定向效应：临近效应是在酶促反应中，底物分子结合到酶的活性中心，底物在酶活性中心的有效浓度大大增加，有利于提高反应速度；酶和底物复合物的形成是把分子间的反应变为分子内的反应的过程,底物分子中参与反应的基团相互接近，并被严格定向定位。定向效应指反应物的反应基团之间、酶的催化基团与底物反应基团之间的正确取位产生的效应,使酶促反应具有高效率。科学家认为,如果临近效应和定向效应的促进作用分别达到提高反应速率104倍,临近效应加定向效应共同作用使反应速率升高108倍,这与酶提高催化效率计算数据很相近.(二)底物的“形变”和诱导契合：当酶遇到专一性底物时,酶中某些基团或离子使底物分子内敏感键中的某些基团的电子云密度增高或降低,产生“张力”,使敏感键的一端更加敏感,底物分子发生“形变”,底物接近过度态,降低了反应活化能,使反应易于发生.如溶菌酶与底物结合引起D-糖环构象由椅式变为半椅式等例子,均为X射线晶体结构分析证实.(三)酸碱催化：是通过瞬时的向反应物提供质子或从反应物接受质子以稳定过度态,加速反应的机制.酸-碱催化可分为狭义的酸-碱催化和广义的酸-碱催化。酶参与的酸-碱催化反应一般都是广义的酸－碱催化方式.是指向反应物提供质子,或是从反应物接受质子的作用，达到降低反应活化能。酶活性部位上的某些基团可以作为良好的质子供体或受体对底物进行酸碱催化。在很多酶的活性部位存在酸碱催化功能基,如氨基,羧基,巯基,酚羟基和咪唑基,它们能在近中性pH的范围,作为催化性的质子供体或受体.这类反应有:羧基的加成反应,酮基和烯醇的互变异构,肽和酯的水解,磷酸和焦磷酸参与的反应.酸碱催化可提高反应速率102-105.His残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团。广义酸基团广义碱基团（质子供体）（质子受体）(四)共价催化(亲核催化或亲电子催化)催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物，使反应活化能降低，从而提高反应速度的过程，称为共价催化。在催化时,亲核催化剂或亲电子催化剂能分别放出电子或吸取电子,作用于底物的缺电中心或负电中心,迅速形成不稳定的中间复合物,降低反应活化能,使反应加速.酶中参与共价催化的基团主要包括His的咪唑基，Cys的巯基，Asp的羧基，Ser的羟基等。某些辅酶，如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。金属离子催化如亲核催化和酸碱催化共同作用.多元催化和协同效应01活性部位位于疏水环境的裂缝中.由于在非极性环境中的介电常数比水的介电常数低,在非极性环境中的两个带电基团之间的静电作用比在极性环境中中显著提高.疏水的微环境有利于酶的催化作用.活性部位微环境02作出选择，以达到对代谢过程的调节控制。酶的特殊结构具有在不同外界环境条件时，03上的特定位点具有传递改变构象信息的能力；该酶可在其分子内、不同的空间位置02特点:（1）别构酶除了有活性中心外，还有别构中心；别构调控－别构酶调节01第二节酶活性的调节控制和调节酶别构酶的结构特征：别构酶的结构特征：