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chw实验六琼脂糖凝胶电泳.pdfVIP

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2.实验原理(Experimentprinciple)

➢在pHpI时,分子碱基几乎不解离,磷酸全部解离,

分子带负电,在电泳时向正极移动

➢采用适当浓度的琼脂糖凝胶介质作为电泳支持物,

琼脂糖是半乳糖及其衍生物构成的中

性物质,从海洋植物中提取的。

优点:•操作简单,电泳速度快,样品不需要事先处理;

•结构均匀,含水量大,样品不易扩散;

•无紫外吸收,过程中和结果可直接用紫外;

•电泳后区带易染色,便于观察;

➢在分子筛的作用下,使分子大小和构象不同的分

子泳动率出现较大的差异,从而达到分离片段检测

其大小的目的。

➢显色:当用低浓度的荧光嵌入溴化乙啶(Ethidium

bromide,EB)染色,在紫外光下至少可以检出1-10ng的条

带,从而可以确定片段在凝胶中的位置

溴化乙锭(EB)—:紫外光下桔红色荧光

影响迁移率的因素

➢的分子大小

➢琼脂糖浓度

➢分子的构象

➢电源电压

➢嵌入的存在

➢离子强度影响

不同浓度琼脂糖分离分子的范围

琼脂糖浓度(W/V,%)分离范围(kb)

0.35-60

0.61-20

0.70.8-10

0.90.5-7

1.20.4-6

1.50.2-4

2.00.1-3

胶浓度越大,越适宜分离的越小

6xLoadingBuffer组成:

EDTA30mM

甘油(Glycerol)36%二甲苯青

二甲苯青(XyleneCyanol)0.035%

溴酚蓝

溴酚蓝(BromophenolBlue)0.05%

本节课使用的上样缓冲液是TAKARA公司的6xLoadingBuffer,含

有溴酚蓝和二甲苯蓝双指示剂系统。

a.溴酚蓝(bromophenolblue,Bb)呈蓝紫色,约与300bp的条带电

泳速率相同;

b.二甲苯青(xylenecyanol,Xc)呈蓝色,它携带的电荷量比溴酚蓝少,

在凝胶中的的迁移率比溴酚蓝慢,

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