计算机化学与分子设计.pptVIP

计算机化学与分子设计;二十世纪八十年代以来，先进的分析仪器的应用、量子化学计算方法的进展和计算机技术的飞速开展，对化学科学的开展产生了冲击性的影响。其研究内容、方法、乃至学科的结构和性质都在发生深刻的变化。

长期以来，化学一直被科学界公认为一门纯实验科学。其理由要追溯到人类认识自然的两种科学方法。;⑴ 归纳法(F.Bacon,1561-1626);迄80年代，归纳法是多数化学家采用的唯一科学方法；演绎法在化学界从未得到普遍成认

原因：①对象复杂；②习惯观念; 运用数学的多少是一门科学成熟程度的标志。; 数学的应用：在刚体力学中是绝对的，在气体力学中是近似的，在液体力学中就已经比较困难了；在物理学中是试验性的和相对的；在化学中是最简单的一次方程式；在生物学中等于零。;恩格斯的论断反映了19世纪中叶自然科学各学科的“成熟程度”。说明各学科研究对象?物质运动形式与规律?其复杂程度的差异

然而，百年来科技的开展使各学科的“成熟程度”发生了巨大变化;化学科学发展简要回顾; 冶金、建材工业推动了无机

药物、染料、酿酒工业推动了有机;物理化学在20世纪初形成。旨在揭示化学反响的普遍规律—反响进行的方向、程度和速度…;物理化学的建立使化学科学开始拥有了理论。高等数学首次派上了用场—虽然仅是一阶的常、偏微分方程而已〔以后在经典统计热力学中用到了概率论〕

经典物理化学的理论是唯象的，是有限的地球空间内宏观化学反响规律的经验总结

30年代量子化学和量子统计力学分支的形成使化学科学开始与演绎法“沾上了边”。但在80年代前进展十分缓慢;⑴ Einstein广义和狭义相对论〔1905〕

⑵ 量子力学的创立〔1925~1926〕;Heisenberg、Schr?dinger、Dirac、Born等于1925~1926创立

30年代初由vonNeumann完成形式理论体系;微观粒子或体系的性质由状态波函数?唯一确定，?服从Schr?dinger方程;历70余年，量子力学经受物质世界不同领域(原子、分子、各种凝聚态、根本粒子、宇宙物质等)实验事实的检验，其正确性无一例外。任何唯象理论无法与之同日而语。;用完备的形式理论体系—统一理论—解释和预测??同科学领域的实验结果。量子力学的“第一原理”(FirstPrinciple)计算〔从头算〕只采用5个根本物理常数：?0、e、h、c、k而不依赖任何经验参数即可正确预测微观体系的状态和性质;20世纪人类荣耀夺目的科技成就大都与量子力学有关。量子理论不仅有力地促进了社会的物质文明改观，且改变了人类的思维方式;量子力学的辉煌使理论物理学家18次共25人荣获诺贝尔物理奖;量子力学的建立和开展促进了：

? 现代化学键理论奠基〔1930〕

Pauling是杰出代表

Slater、Mulliken、Hund、Heitler-London分别作出奉献

? 量子力学引入化学，促进量子化学、量子统计力学形成

Einstein-Bose、Fermi-Dirac两种统计理论

Hückel分子轨道理论〔1932〕

Roothaan方程〔1952〕计算量子化学开展;化学科学的体系和结构发生深刻变化

对象： 宏观现象?微观本质

方法学： 描述、归纳?演绎、推理

理论层次：定性?定量

化学与物理学的界限在模糊，在理论上趋于统一

化学各分支学科的交叉；与其他学科相互渗透

带动生物、材料科学进入分子水平

与化学相关的新领域不断涌现;化学及交叉学科的开展促进了数学向化学的渗透

? 众多的数学工具应用于物理化学领域：

矩阵代数复变函数数理方程数理统计

数值方法群论不可约张量法李代数

非线性数学模糊数学分型理论与方法

? 数学与物理化学的交叉使有关的数学知 识在其他各化学分支亦得以应用;一门新的交叉学科?计算机化学?已形成。它将帮助化学家在原子、分子水平上说明化学问题的本质，在创造特殊性能的新材料、新物质方面发挥重大的作用。;计算机化学是化学与多个学科的交叉;体系数据和性质的综合分析;化学数据库〔Database〕

分子结构库晶体库热力学数据库药物库

高分子库分子光谱、波谱图谱库

生物数据库〔蛋白质、核酸、多糖库〕

化学文献库

化学人工智能〔需借助数据库〕

计算机辅助分子结构解释化学模式识别

结构－活性关系分析

结构－性质关系分析

神经网络算法与神经网络计算机;分子结构建模与图形显示;分子的计算机模拟;Whatis

MolecularModeling?;为何进行分子计算机模拟?;分子模拟将原子、分子按经典粒子处理，可提供微观结构、运动过