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病原学诊断
Diagnosticmicrobiology;内容
Contents
;;〔1〕目的:直接检测微生物〔细菌、真菌、寄生虫虫卵幼虫和成虫、感染的细胞中的病毒包涵体〕;初步或明确鉴定微生物;;;;;;;〔3〕检查方法:;〔1〕成功取决于:
微生物的生物学特性
感染的部位
患者对感染的免疫反响
适宜培养基〔三种类型〕和条件;培养基类型〔细菌和真菌〕;培养基类型〔衣原体、立克次体和全部病毒〕:细胞培养;〔1〕分子种类:
DNA
RNA
蛋白质
〔2〕优势:
适宜于不能别离或免疫学检查的微生物检查;
检测基因型或突变〔eg.耐药〕
敏感、特异和平安;;Restrictionfragmentlengthpolymorphism〔RFLP,限制性片段长度多态性〕distinctionofDNAfrombacterialstrainsseparatedbypulsed-fieldgelelectrophoresis.
Lanes1to3showSma1restrictionendonuclease-digestedDNAfrombacteriafromtwofamilymemberswithnecrotizingfasciitisandfromtheirphysician(pharyngitis).Lanes4to6arefromunrelatedStreptococcuspyogenesstrains;DNAprobe〔DNA探针〕analysisofvirus-infectedcells.SuchcellscanbelocalizedinhistologicallypreparedtissuesectionsusingDNAprobesconsistingofasfewasninenucleotidesorbacterialplasmidscontainingtheviralgenome.AtaggedDNAprobeisaddedtothesample.Theappropriatesubstrateisaddedtocolor
thenucleiofvirallyinfectedcells.;Insitulocalization〔原位杂交〕ofcytomegalovirus(CMV)infectionusingageneticprobe.CMVinfectionoftherenaltubulesofakidneyislocalizedwithabiotin-labeled,CMV-specificDNAprobeandisvisualizedbymeansofthehorseradishperoxidase-conjugatedavidinconversionofsubstrate,inamannersimilartoenzymeimmunoassay.;多聚酶链反响;DNAchip〔基因芯片〕
16srRNA测序或全基因组测序
蛋白组和质谱;检测和定量抗原
评价抗体反响
评估是否暴露或免疫接种;Analysisofantigensandantibodiesbyimmunoprecipitation〔免疫沉淀〕;Immunofluorescenceandenzymeimmunoassaysforantigenlocalizationincells.Antigencanbedetectedbydirectassaywithantiviralantibodymodifiedcovalentlywithafluorescentorenzymeprobe,orbyindirectassayusingantiviralantibodyandchemicallymodifiedantiimmunoglobulin.Theenzymeconvertssubstratetoaprecipitate,chromophore,orlight.;Immunofluorescencelocalizationofherpessimplexvirus–infectednervecellsinabrainsectionfromapatientwithherpesencephalitis.;Flowcytometry
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