核酸的化学组成.ppt

到目前为止，核酸中发现了近80种特别的组分，它们绝大多数是基本组分的衍生物，即在碱基或核糖的某些位置上附加或取代掉某些基团。把这些特别的组分称为修饰组分（也称稀有组分或附加组分）。二、核酸的修饰组分1948年Hotchkiss在小牛胸腺DNA中检测到5－甲基胞嘧啶脱氧核苷，这使人们认识到，除了基本组分外，核酸中还有一些特别的组分存在。第23页，共53页，星期日，2025年，2月5日1.含有修饰碱基的核苷目前在RNA和DNA中已检测到60多种核苷含有修饰碱基。比较简单的修饰是原有的嘌呤或嘧啶上某个原子被甲基、甲硫基、羟甲基等取代，或经脱氨、加氢等成为修饰组分。如：m5C、S4U、DHU、I、m6A、m7G等。2.含有修饰核糖的核苷目前只发现一种修饰核糖，即核糖2’－OH上的H原子被甲基取代，生成β－D－2’－O-甲基核糖，如：Cm(2’-o-甲基胞苷）。含有修饰核糖的核苷只存在于RNA中，其中有些是碱基和核糖同时被修饰。第24页，共53页，星期日，2025年，2月5日3.含有C-C糖苷键的核苷目前所知只有假尿嘧啶核苷及其衍生物属此。尿嘧啶核苷中糖苷键是N1-C1’,而假尿苷（ψ）中是C5-C1’相连。tRNA中修饰组分种类最多，有60多种。rRNA中的修饰组分有10多种，其中多数是甲基化修饰。原核mRNA分子中至今未发现有修饰组分，真核mRNA中的修饰组分只有几种，主要是在帽子结构中的m7G、m22,7G、m32,2,7G、Nm和分子内部顺序中的m6A、m5C。第25页，共53页，星期日，2025年，2月5日4.DNA的甲基化修饰甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。DNA的甲基化修饰发生在DNA中一定的碱基顺序上，而且呈180°旋转对称。如脊椎动物DNA的甲基化多数在5’CpG3’顺序的C上，与它互补的3’GpC5’顺序中的C也是甲基化的。第26页，共53页，星期日，2025年，2月5日各种生物体中DNA甲基化的特征≤90%的位点特征脊椎动物植物大肠杆菌甲基化碱基甲基化顺序甲基化程度甲基化位点的180°旋转对称性m5dCm5dCm5dC,m6dACGCG,CXG(X=A,C,T)CCA(T)GG,GATC≤90%的位点～100%的位点＋＋＋第27页，共53页，星期日，2025年，2月5日DNA甲基化是表观遗传修饰的一个重要机制，它能从一个DNA序列产生不同模式的基因表达。它对正常发育至关重要，其功能失常可引起癌症和其他异常。现在，研究人员利用高通量亚硫酸氢盐测序与单分子测序相结合的方法，以核苷酸分辨率获得了在胚胎干细胞中和在由它们形成的各种不同的细胞类型中DNA甲基化的一个分布图。该分布图显示了基因组中甲基化随细胞发育（如当胚胎干细胞成熟成为神经细胞时）而变化的特定点。更具普遍意义的是，这种方法对于与发育生物学、癌症和再生医学相关的细胞群的表观遗传分析将会是有价值的。DNA甲基化修饰第28页，共53页，星期日，2025年，2月5日DNA甲基化修饰的作用E.coli中，可以保护DNA免受本身限制性核酸内切酶的切割，而从外界侵入的外源DNA却会被E.coli的限制性核酸内切酶降解，这样就大大减少了无关种类之间的基因转移效率。最近几年研究表明，DNA甲基化在E.coliDNA的错配修复中也有重要作用。在高等生物中，DNA甲基化可能影响蛋白质和DNA的相互作用，从而调节基因的表达和胚胎发育。一些研究结果表明，低甲基化是基因活跃转录的必要条件之一。第29页，共53页，星期日，2025年，2月5日DNA甲基化抑制基因转录的机理用组蛋白Hl与含CCGG序列的甲基化和非甲基化DNA实验后发现：甲基化达到一定程度时会发生从常规的B-DNA向Z-DNA的过渡。由于Z-DNA结构收缩，螺旋加深，使许多蛋白质因子赖以结合的元件缩入大沟而不利于基因转录的起始。DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化，影响蛋白质与DNA的相互作用；抑制转录因子与启动区DNA的结合效率。第30页，共53页，星期日，2025年，2月5日用序列相同但甲基化水平不同的DNA为材料，比较其作为RNA聚合酶转录模板的活性，发现甲基的引入不利于模板与RNA聚合酶的结合，降低了其体外转录活性。5-甲基胞嘧啶在DNA上并不是随机分布的，基因的5端和3’端往往富含甲基化位点，而启动区DNA分子上的甲基化密度与基因转录受抑制的程度密切相关。DNA甲基化抑制基因转录的机理第31页，共53页，星期日，2025年，2月5日一、核酸的一般化学组分二、核酸的修饰组分