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ICS65.020.20
CCSB16
22
吉林省地方标准
DB22/T3601—2023
人参锈腐病菌分子检测实时荧光定量PCR
法
DetectionofIlyonectriarobustacausingginsengrustyrootrotby
quantitativereal-timePCR
吉林省市场监督管理厅
发布
DB22/T3601—2023
前
言
本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的
规定起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。
本文件由吉林省农业农村厅提出并归口。
本文件起草单位:吉林农业大学、吉林参王植保科技有限公司。
本文件主要起草人:陈长卿、姜云、高洁、徐怀友、卢宝慧、杨丽娜、姜伊琳。
I
DB22/T3601—2023
人参锈腐病菌分子检测实时荧光定量PCR法
1
范围
本文件确立了人参锈腐病菌实时荧光定量PCR分子检测方法,给出了实时荧光定量PCR检测原
理,规定了试剂和材料、仪器设备、样品采集与制备、分析步骤、结果判定、废弃物处理和防止污染的
措施。
本文件适用于人参根和土壤中锈腐病菌的实时荧光定量PCR分子检测。
2
规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本
文件。
GB/T6682
分析实验室用水规格和试验方法
GB/T28067甘蔗黄叶病毒实时荧光RT-PCR检测方法
3
术语和定义
一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测定每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方
4
根据人参锈腐病强壮土赤壳菌I.robusta组蛋白Histone基因的保守序列设计一对特异性引物
进行PCR扩增反应。利用荧光信号伴随目的PCR产物的增加而增强的原理,收集PCR扩增过程的荧
光信号值。随着PCR扩增反应的进行,Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,根据Ct值判断
供试样品是否含有人参锈腐病强壮土赤壳菌。
5
1
DB22/T3601—2023
通用要求
除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。
试剂
5.2.1
水,GB/T6682,一级。
5.2.2
5.2.3
5.2.4
植物基因组DNA提取试剂盒。
土壤总DNA提取试剂盒。
实时荧光定量PCR试剂盒。
引物
5.3.1
引物序列
上游引物:5′-CCGCCGACCTGACCTGACCGTCCGCC-3′,下游引物:5′-ATGATGTTTGATGCGAGACGTAA-3′。
5.3.2
引物配制
引物用水稀释成10μmol/L,-20℃保存备用。
6
仪器设备
天平:感量0.001g。
实时荧光定量PCR仪:激发/检测波长范围350nm~750nm,可用荧光染料(SYBRGreenⅠ);
升降温速度≥3.0℃/s;均一性≤±0.5℃;准确性≤±0.3℃;温度范围4℃~100℃。
离心机:离心转速12000rpm以上。
微量移液器:0.1μL~2.5μL,2μL~20μL,20μL~200μL,100μL~1000μL。
核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计。
恒温水浴锅。
7
2
DB22/T3601—2023
无菌一级水。
样品采集与制备
7.2.1
人参
采集新鲜人参根,装入密封袋,置于冰盒中,在实验室用研磨机将参根打碎,充分混合,4℃保
存不超过12h,也可-80℃长期保存。
7.2.2
土壤
每25m人参田块采用梅花形采样法,不少于5点,每个点取人参根际土壤样品50g,装入密
2
封袋,充分混合,置于冰盒中,4℃保存不超过12h,也可-80℃长期保存。
8
分析步骤
基因组DNA提取
准备人参根样品和土壤样品,参照基因组DNA提取试剂盒说明要求提取基因组DNA。采用核酸蛋
白分析仪测定DNA浓度和纯度。当DNA浓度为100ng/μL~200ng/μL,A260/A280比值为1.8~
2.0之间时,DNA模板适宜荧光定量PCR扩增。用无菌一级水将模板DNA浓度稀释成50ng/μL用
于荧光定量PCR扩增。
实时荧光定量PCR反应
表1实时荧光定量PCR反应体系
试剂
2×SYBRGreenMix
正向引物(10μmol/L)
反向引物(10μ
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