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多年生水稻分子图谱的构建、解析及应用研究

目录

多年生水稻分子图谱的构建、解析及应用研究（1）．．．．．．．．．．．．．．3

一、内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

（一）研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

（二）研究内容与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

二、多年生水稻基因组概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

（一）多年生水稻基因组的特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

（二）基因组研究的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

三、多年生水稻分子图谱构建方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

（一）基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

（二）基因组组装与注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

（三）分子图谱构建策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

四、多年生水稻分子图谱解析与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

（一）基因组结构与进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

（二）基因与基因组关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

（三）表观遗传学与基因表达调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

五、多年生水稻分子图谱的应用研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

（一）遗传育种中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

（二）基因编辑与分子育种．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

（三）生物多样性与生态适应性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

六、挑战与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

（一）当前面临的挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

（二）未来发展方向与前景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

七、结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

（一）研究成果总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

（二）对未来研究的启示．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

多年生水稻分子图谱的构建、解析及应用研究（2）．．．．．．．．．．．．．40

一、文档综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

1.2研究内容与目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

1.3研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

二、多年生水稻基因组与转录组数据获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

2.1基因组测序技术的选择与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

2.2转录组测序数据的获取与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

2.3数据库建设与共享．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

三、多年生水稻分子图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

3.1图谱构建的方法与策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.2特征基因与关键位点的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.3图谱的质量控制与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57

四、多年生水稻分子图谱解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

4.1基因与基因组结构解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60

4.2转录组