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分子轨道方法（上）量子化学计算方法与应用---3/11/12

目录从头算程序结构与输入基函数的选择主要积分计算自洽场计算分子性质

目录从头算程序结构与输入基函数的选择主要积分计算自洽场计算分子性质

从头算程序结构与输入软件分类计算原理研究对象(abinitio/firstprinciples)Gaussian、ADF、Dalton、Gamess、Crystal、VASP、Wien、Dmol等基于从头算或第一性原理方法MOPAC、EHMO、NNEW3等基于半经验或分子力学方法Gaussian、ADF、Dalton、Gamess、MOPAC、EHMO等无限周期重复体系(晶体、固体表面、链状聚合物等)Crystal、NNEW3、VASP、Wien等有限尺度体系(分子、簇合物等)

Gaussian09程序结构与功能与构型优化和反应过渡态相关的模块

Gaussian09程序结构与功能01与基组和赝势有关模块02输出距离矩阵、判断化合物点群及确定新的坐标系03计算单电子及双电子积分模块04SCF初始猜测模块05SCF模块

Gaussian09程序结构与功能计算能量一阶和二阶导数模块Mulliken布居以及自然键轨道(NBO)分析模块与Post-SCF方法有关模块

Gaussian09程序结构与功能进程结束模块说明：1.根据不同的任务，某些模块需重复调用多次；2.通常耗时较多的模块有：L5,L7,L8,L9,L10,L11等，此外,L8~L11这些模块的执行对内存和硬盘的需求较大；3.可根据各个模块的功能，对G09程序进行简化，例如如果用户通常只用G09进行能量计算，则可只保留L1~6和L9999模块其它模块可以删除去。

Gaussian09程序输入体系所带电荷以及自旋多重度(S=2s+1=成单电子数+1)

Gaussian09程序输入

Gaussian09程序输入主要有两种描述分子构型的方法：a.直角坐标系方法：(适用于全自由度构型优化情况)格式为：元素符号xyz例如：O-0.4640.1770.0 H-0.4641.1370.0H0.441-0.1430.0说明：1)元素符号大小写均可，也可直接采用原子序数；2)有时为了便于区别，可在元素符号后加一整数，如：O-0.4640.1770.0H1-0.4641.1370.0H20.441-0.1430.03)x,y,z数值必须以小数格式输入：O-0.4640.1770(?)O-0.4640.1770.(?)4)G09的数据输入均为自由格式，即除了用空格来分隔数据外，也可用逗号或混合使用；

Gaussian09程序输入键长键角二面角内坐标与直角坐标之间的区别在于，它侧重于从原子之间的键连角度来描述原子间的相对位置，具体参数包括：b.内坐标(z-matrix)方法：(适用于构型的局部优化)即两个原子间的距离，注：该两个原子并非要具有化学直观意义上的成键。此外，在默认情况下，键长单位为埃。1)键长：(需用两个原子描述)确定了二根键之间的夹角，默认单位为度，范围为-180~180deg之间。2)键角：(需用三个原子描述)二面角加上键长和键角就确定了四个原子的位置，其默认单位为deg，范围为-360~360deg。当二面角等于0，±180和±360deg时四个原子共面。内坐标的输入格式为：原子1,原子2,键长,原子3,键角,原子4,二面角3)二面角：(需用四个原子描述)

目录从头算程序结构与输入基函数的选择主要积分计算自洽场计算分子性质

对多原子分子,其轨道必须用原子轨道的线性组合(LCAO)来近似表示基函数的选择?称为基函数，其中心通常选在原子上，比原子轨道更具一般性。当基函数足够多足够好时,得的分子轨道就能相当准确。类氢离子波函数：关联Laguerre多项式，迭代收敛慢。基函数的一般形式

Slater函数对径向部分加以内层电子静电屏蔽矫正，造成无径向截面的函数形式。对于氢原子或类氢离子,STO是精确的轨道.在对原子计算中,STO是非常好的基函数.STO正确的渐近性质,在r趋于完全大时,函数趋于零的速度与真实情况是符合的.STO在原子核处满足尖点性质,即在r趋于零时形成