香蕉SCoT-PCR反应体系优化及遗传多样性分析.pdfVIP

分子植物育种，2025年，第23卷，第6期，第1874-1880页

MolecularPlantBreeding2025,Vol.23,No.6,1874-1880

研究报告

ResearchReport

香蕉SCoT-PCR反应体系优化及遗传多样性分析

陈文亮王楚乔刘建福陈科霖

李雨晴王明元*王林萍

华侨大学生物工程与技术系，华侨大学园艺科学与工程研究所，厦门，361021

*通信作者，w_mingyuan@163.com

摘要本研究以福建省6个香蕉品种为材料，采用正交试验设计对香蕉SCoT-PCR体系进行优化，筛选适用

于香蕉的SCoT多态性引物，同时对18份香蕉种质资源材料进行遗传多样性分析。结果显示：香蕉的SCoT-PCR

最佳反应体系(20μL)为:dNTPMix0.2mmol/L、Taq聚合酶2U、引物1μmol/L、DNA模板20ng。同时筛选出条

带清晰、多态性丰富的11条SCoT引物及其最适退火温度。共扩增出102个特异性条带，平均多态率为82.50%。

UPGMA聚类结果显示18份材料分为了三大类群。SCoT引物的Na、Ne、H、I平均值分别为1.8235、1.4979、

0.2934、0.4394，表明具有良好的多态性可用于香蕉的标记。基因差异分化系数G=0.8993，说明不同香蕉品种

之间发生了较大的变异分化。研究表明SCoT分子标记可以应用于香蕉的遗传多样性分析。

关键词香蕉；体系优化；SCoT分子标记；遗传多样性分析

SystemOptimizationofSCoT-PCRandGeneticDiversitAnalysisofMusa

ChenWenliangLiYuqingWangMingyuan*ILinPingLiuJianfuChenKelin

WangChuqiao

DepartmentofBioengineeringandTechnology,HuaqiaoUniversity,InstituteofHorticulturalScienceandEngineering,HuaqiaoUniversity,Xiamen,

361021

*Correspond11authouan@163.com

DOI:10.132pb.023.001874

AbstractInthisstudy,6bananavarietiesinFujianProvincewereusedasmaterials,theSCoT-PCRsystemof

bananawasoptimizedbyorthogonaldesign,theSCoTpolymorphicprimerssuitableforbananawerescreened,

andgeneticdiversityof18bananagermplasmmaterialswereanalyzed.TheresultsshowedthattheoptimalPCR

system(20μL)contains0.2mmol/LdNTPMix,2UTaqpolymerase,1μmol/Lprimer,20ngDNAtemplate.At

thesametime,11SCoTprimerswithclearbandsandrichpolymorphismwerescreenedoutanddeterminetheir

optimalannealingtemperature.Atotalof102DNAbandswereamplified,withanaveragepolymorphismrateof

82.50%.UPGMAclusteringresultsshowedthat18materialsweredividedintothreemajorgroups.Theaverage

valuesofNa,Ne,H,andIofSCoTprimerswere1.823