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基于从头计算的蛋白质结构预测

从头计算方法概述

从头计算方法（denovoproteinstructureprediction）是指在没有已知同源结构的情况下，仅基于氨基酸序列预测蛋白质三维结构的方法。这种方法不依赖于已知的模板结构，而是通过计算物理和化学原理来预测蛋白质的折叠方式。从头计算方法主要包括以下几个步骤：

初始构象生成：生成蛋白质的初始构象集合。

能量函数评估：使用能量函数评估每个初始构象的稳定性。

构象优化：通过优化算法（如分子动力学模拟、蒙特卡罗模拟等）找到能量最低的构象。

模型评估与选择：评估优化后的模型，选择最佳的结构模型。