猪圆环病毒Ⅱ型感染3D4_2细胞的转录组学分析.pdfVIP

中国畜牧兽医2024,51(1)：42-51

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猪圆环病毒型感染3D4/2细胞的转录组学分析

赵怡，陈家骥，韦秋旭，李禧梦，冯国越，胡翔，胡庭俊

陈虹伶，赵

（广西大学动物科学技术学院，南宁530005）

摘要：【目的】通过转录组测序筛选猪圆环病毒ⅡI型（PorcinecircovirustypeⅡI，PCV2）感染猪肺泡巨噬细胞系

(3D4/2)差异表达基因，为了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和抗PCV2感染药物研发奠定基础。【方法】用感染

复数（multiplicityofinfection，MOI)为1的PCV2NJ2002株处理3D4/2细胞，利用IluminaNovaSeq6000测序平

台进行转录组测序。使用DeSeq2.0软件进行差异表达基因分析，并对差异表达基因进行基因本体论（GO）、京都

基因与基因组百科全书(KEGG)功能分析及转录因子靶向分析,选取免疫及调亡相关基因进行实时荧光定量PCR

验证，用Westernblotting技术检测细胞内磷脂酰肌醇激酶（PI3K)及磷酸化胞内磷脂酰肌醇激酶（p-PI3K）、蛋白激

酶B(Akt)和磷酸化蛋白激酶B(p-Akt)蛋白表达水平。【结果】转录组测序结果显示，与对照组相比,PCV2感染组

共获得713个差异表达基因，其中313个上调，400个下调。GO功能和KEGG通路富集分析显示，差异表达基因

与免疫应答等相关，主要富集在细胞外基质受体互作通路、新陈代谢通路、HIF-1信号通路、病毒致癌作用、PI3K-

Akt等信号通路。实时荧光定量PCR结果与转录组测序的基因表达水平保持一致。Westernblotting检测结果显

示，PCV2感染3D4/2细胞24h后PI3K和Akt蛋白磷酸化水平显著升高（P0.05）。转录因子靶向分析表明，差

异表达基因与核转录因子Y亚基β(NFYB)和ETS转录因子(ELK4)联系紧密。【结论IPCV2可能通过PI3K-Akt

信号通路影响下游炎症信号通路和调亡信号通路增强自身复制能力。NFYB和ELK4转录因子在PCV2感染过

程中可能发挥重要作用，可考虑作为抗PCV2药物靶点。研究结果为深人了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和相

关药物开发提供了理论基础。

关键词：猪圆环病毒ⅡI型；3D4/2细胞；转录组测序；差异表达基因；转录因子

中图分类号：S852.3文献标识码：A

Doi:10.16431/ki.1671-7236.2024.01.005开放科学（资源服务）标识码（OSID)：

TranscriptomicAnalysisof3D4/2CellsInfectedwithPorcineCircovirusTypeI

CHENHongling,ZHAOYi,CHENJiaji,WEIQiuxu,LIXimeng,FENGGuoyue,

HUKunxiang,HUTingjun

(CollegeofAnimalScienceandTechnology,GuangxiUniversity,Nanning530005,China)

Abstract:[Objective]Theaimofthisstudywastoscreenthedifferentiallyexpressedgenesof

PorcinecircovirustypeII

transcriptomesequencing,andlayafoundationforunderstandingthehostimmunecellmechanism

ofPCV2infectionandthedevelopmentofanti-PCV2infectiondrugs.Method]PCV2NJ2002

strainwithmultiplicityofinfection

transcriptomesequencing