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分子植物育种，2021年，第19卷，第9期，第3015-3021页
MolecularPlantBreeding,2021,Vol.19,No.9,3015-3021
研究报告
ResearchReport
灰毡毛忍冬转录组SSR位点分析及EST-SSR标记开发
刘思思@乔中全曾慧杰2李永欣2蔡能2刘新民王晓明
1湖南中医药大学中西医结合学院，长沙，410208;2湖南省林业科学院长沙市木本花卉工程技术研究中心，长沙，410004;3中国医学科学院北
京协和医学院药用植物研究所，北京，100193
*同等贡献作者
**共同通信作者，liuxinmin@hotmailxom;wxml964@163.com
摘要灰毯毛忍冬(Lonicem为中药山银花的一种基原植物，在中国南方广泛分布，具有很
高的药用价值和经济价值。本研究利用MISA工具对灰毡毛忍冬转录组74057条Unigenes中的SSR位点
进行了分析，其中15587条Unigene共计含有SSR位点2016丨个，SSR发生频率为21.05%。灰毡毛忍冬转
录组SSR位点的种类从单核苷酸至六核苷酸重复均有分布，主要重复类型是二核苷酸(9704个)和三核苷酸
(5847个)，分别占8811总数的48.13%和29.00%,主要重复单元为八0/(：丁（6086)、八17八1(3071)和八/丁
(2826)，分别占SSR总数的30.19%、15.23%和14.02%。SSR位点的重复次数分布最多的是6和5次，分别
有4897和3531个，分别占总SSR数的24.29%和17.51%。利用Primer6.0软件设计了17611对SSR引
物，随机选出30对引物进行扩增验证，其中14对扩增条带表现出多态性，进而利用这14对引物对6个灰毡
毛忍冬品种开展了遗传多样性分析。本研究结果将为灰毡毛忍冬物种鉴定、遗传多样性分析和分子标记辅
助育种等提供科学依据。
关键词灰毯毛忍冬(ionfceraSSR;分子标记；转录组
AnalysisonSSRLociinTranscriptomeandDevelopmentofEST-SSR
MolecularMarkersinLoniceramacranthoides
LiuSisiQiaoZhongquan2*ZengHuijie2LiYongxin2CaiNeng2LiuXinmin1,3”WangXiaoming2**
1CollegeofIntegratedTraditionalChineseandWesternMedicine,HunanUniversityofChineseMedicine,Changsha,410208;2ChangshaEngineer
ingTechnologyResearchCenterofWoodyflower,HunanAcademyofForestry,Changsha,410004;3InstituteofMedicinalPlantDevelopment,Chi
neseAcademyofMedicalScienceandPekingUnionMedicalCollege,Beijing,100193
*Theseauthorscontributedequallytothiswork
**Co-correspondingauthors,liuxinmin@;wxml964@163.com
DOI:10.13271/j.mpb.019.003015
AbstractAsaspeciesoforiginalplantofflosLonicerae,LoniceramacranthoidesiswidelydistributedinSouth
Chinaandfeatureshighmedicinalandeconomicvalue.Inthisstudy,theSSRlociof74057unigen
初级会计持证人
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