海南岛火焰兰SSR标记开发、遗传多样性与群体结构分析.pdfVIP

分子植物育种，2023年，第21卷，第7期，第2300-2310页

MolecularPlantBreedingNo.7,2300-2310

研究报告

ResearchReport

海南岛火焰兰SSR标记开发、遗传多样性与群体结构分析

赵慧琪12*吴芳芳4黄赛12张永豪12张浪1.2杨珺1.2

赵慧琳3

李栋梁1.2*任军方1.2**

1海南省农业科学院三亚研究院，三亚，572025；2海南省农业科学院热带园艺研究所，海南省特种经济植物种质资源创新利用重点实验室，国

家种质资源澄迈观测实验站，海口，571100；3山西省植物保护植物检疫中心，太原，030001；4海南大学园艺学院，海口，571100

*同笙贡献作者

*同等贡献作者

**通信作者，renjunfang808@163.com

摘要为了开发火焰兰(Renantheracoccinea)的SSR引物，进而开展海南岛火焰兰的种质鉴定、遗传多样

性和群体结构分析。本研究采用三代测序技术首先获得火焰兰参考转录组，然后开发了火焰兰的SSR引物，

最后基于SSR引物利用分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构

分析等方法对来自海南岛不同地理分布的396份火焰兰资源进行研究。结果表明，所开发的17对三核苷酸

多态性SSR引物能够有效地鉴别所收集的396份火焰兰种质。AMOVA分析显示，火焰兰群体间呈现极高

程度的遗传分化，并且群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异。群体结构分析显示，来自不同地理分布的

海南岛火焰兰存在3个不同的基因库，而且绝大多数群体是独立进化的，只有少数群体存在遗传混合，这一

结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。综上可知，本研究新开发的17对SSR引物有效鉴定了396

份海南岛火焰兰种质，揭示了其遗传多样性和群体遗传结构，对火焰兰的种质资源保护和育种计划具有非常

重要的参考价值。

关键词火焰兰；SSR标记；遗传多样性；群体结构

SSRMarkerDevelopment,GeneticDiversityandPopulationStructure

AnalysesofRenantheracoccineainHainanIsland

ZhaoHuiqi12*LiDongliangl2*ZhaoHuilin3WuFangfang4HuangSaiI2ZhangYonghaol2ZhangLangl2

YangJunI.2RenJunfangl.2**

1SanyaInstitute,HainanAcademyofAgriculturalSciences,Sanya,572025;2NationalGermplasmResourceChengmaiObservationandExperiment

Station,TheKeyLaboratoryofTropicSpecialEconomicPlantInnovationandUtilization,InstituteofTropicalHorticultureResearch,HainanAcademy

ofAgriculturalSciences,Haikou,571100;3PlantProtectionandQuarantineCenterofShanxiProvince,Taiyuan,030001;4SchoolofHorticulture,

HainanUniversity,Haikou,571100

*Theseauthorscontributedequallytothiswork

**Correspondingauthor,renjunfang808@163.com

DOI:10.1327mpb.021.002300

AbstractInordertodevelopSSRprimersforRenantheracoccinea,andthentocarryoutitsgermplasmidentifi-

cation,geneticdiversitya