李白盾蚧转录组分析及SSR位点开发.pdfVIP

环境昆虫学报2023，45（5）：1318－1332

JournalofEnwironmentalEntomologydoi:10.3969/j.issn.1674-0858.2023.05.18

杜炫星，牛敏敏，赵清，蔡波，卢运运，魏久锋，张虎芳．李白盾转录组分析及SSR位点开发［J]．环境昆虫学报，2023，45（5）：

1318-1332.

李白盾转录组分析及SSR位点开发

杜炫星，牛敏敏，赵清，蔡，波”，

卢运运，魏久锋，张虎芳1.2*

（1.山西农业大学植物保护学院，山西太谷030801；2.州师范学院生物系，山西忻州034000；

3.海口海关热带植物隔离检疫中心，海口570311）

摘要：李白盾Pseudaulacaspisprunicola（Maskell）寄主范围广泛，是一种重要的人侵害虫。本研究利用高通量测

序平台（IlluminaNovaSeq6000）对李白盾进行转录组测序、denovo从头组装及功能注释，在此基础上筛选其微

卫星（SSR）位点，并挖掘微卫星引物。研究共获得李白盾转录组60296条转录本，24967条单基因

（unigenes）序列。通过GO数据库注释，将所有unigenes的功能分为生物学进程、细胞组分和分子功能三大类

41个亚类功能区。K0G数据库注释结果显示，5085条unigenes归到25个基因家族，注释到一般功能预测的数目

最多。KEGG代谢通路富集分析显示6668条unigenes注释到280个代谢通路，其中注释到内质网中蛋白质加工的

数目最多。利用MISA软件共搜索到微卫星位点18193个，分布在9043条unigenes中，占总unigenes数量的

36.22%，平均每2.29kb出现一个SSR位点。其中主要重复类型为单核苷酸重复，占SSR位点总数的72.03%，

其次为三核苷酸重复（15.90%）和二核苷酸重复（8.48%）。单核苷酸重复主要为A/T（71.16%），二核苷酸重

复主要为AG/CT（5.20%）。基于PrimerPrimer3软件设计出12538对李白盾SSR引物，从中随机挑选50对引

物进行PCR验证，共29对引物可以稳定扩增出目的片段。本研究成功组装了李白盾转录组数据，并基于转录

组数据成功筛选出其微卫星位点，为未来该虫的种群遗传学以及入侵生物学研究提供了数据支撑。

关键词：李白盾；高通量测序；转录组分析；微卫星；分子标记

中图分类号：Q963；S433文献标识码：A

AnalysisofthetranscriptomeanddevelopmentofSSRLociinPseudaulacaspis

prunicola(Maskell)

DUXuan-Xing,NIUMin-Min,ZHAOQing,CAIBo,LUYun-Yun,WEIJiu-Feng,ZHANG

Hu-Fang2*(i.ShanxiAgrieulturalUniversity,CollegeofPlantProtection,TaiguO30801,Shanxi

Province,China;2.XinzhouTeachersUniversity,DepartmentofBiology,Xinzhou034000,Shanxi

Province,China;3.HaikouCustoms,TropicalPlantQuarantineCenter,Haikou570311,China)

Abstract:Pseudaulacaspisprunicola(Maskell)isanimportantinvasivepestwithawidehostrange.The

transcriptomeofP.prunicolawassequencedbasedonhigh-throughputsequencingplatform