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分子植物育种,2024年,第22卷,第22期,第7327-7336页
MolecularPlantBree22,7327-7336
研究报告
ResearchReport
甘薯IbCHLI1基因的克隆及生物信息学分析
刘洋2赵路宽2邓逸桐2
高兵倩12王2曹清河2*邹华文*
1长江大学农学院,荆州,434023;2中国农业科学院甘薯研究所,江苏徐淮地区徐州农业科学研究所,徐州,221132
*共同通信作者,zouhuawen@;cqhe75@
摘要甘薯[lpomoeabatatas(L.)Lam.]是重要的粮食、保健、工业原料和能源作物,而一些甘薯品种因叶型
或叶色丰富被作为观赏植物或绿化植物。CHLII基因编码叶绿素合成途径中镁离子螯合酶(MgCh)的ChlI
亚基,对叶绿素的合成以及叶绿体的发育至关重要,并影响植物叶片着色。本实验以‘徐薯29号为材料,采
用RT-PCR方法克隆CHLII基因对其进行生物信息学分析,并进行了不同部位的表达模式分析。结果表明,甘
薯IbCHLI1基因最大阅读框(ORF)长度为1281bp,编码426个氨基酸,蛋白质相对分子质量为46184.90Da,
其分子式为C2032H332Ns6sO632S1,原子总数为6575,理论等电点为5.68;该蛋白属于亲水性非分泌蛋白,定位
在叶绿体中,稳定性较好,不存在跨膜结构域以及信号肽,有多个磷酸化位点;该蛋白二级结构主要包括α-
螺旋(42.25%)、无规卷曲(35.21%)、延伸链(15.96%)和β-转角(6.57%),三级结构预测结果显示该蛋白含有核
苷三磷酸水解酶的P-loop环,保守结构域预测结果显示该蛋白是含有AAA结构域的ATP结合蛋白,属于
ChlI超家族;系统进化分析发现该蛋白与三裂叶野牵牛(lpomoeatriloba)的CHLI1蛋白亲缘关系最近,序列
相似性达到99.30%。组织特异性表达分析结果显示IbCHLI1基因在甘薯不同组织中存在明显的组织表达特
异性,在叶片中表达量最高,在根中表达量最低。以上对IbCHLI1基因在甘薯中的初步分析将为后续利用基
因工程手段创制观赏甘薯新种质提供理论依据,
关键词甘薯[Ipomoeabatatas(L.)Lam.];镁离子螯合酶(MgCh);CHLIl;基因克隆;生物信息学
CloningandBioinformaticsAnalysisofIbCHLIIGeneinSweetpotato
GaoBingqianI.2WangYao?LiuYang?ZhaoLukuan?DengYitong?CaoQinghe2*ZouHuawen1*
1CollegeofAgriculture,YangtzeUniversity,Jingzhou,434023;2JiangsuXuhuaiReigionXuzhouInstituteofAgriculturalSciences,SweetpotatoRe-
searchInstitute,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Xuzhou,221132
*Co-corre:authorszouhiawe75@
DOI:10.13271/j.mpb.022.007327
AbstractSweetpotato[lpomoeabatatas(L.)Lam.]isanimportantfood,health,industrialrawmaterialsanden-
ergycrop.Amongthem,somesweetpotatovarietiesareusedasornamentalorgreenplantsbecauseoftheirrich
leafshapesorcolorsandornamentalvalues.TheCHLIlgeneencodestheChlIsubunitofmagnesiumionchelatase
(MgCh)inthechlorophyllsynthesispathway,whichisessentialforchlorophyllsynthesisanditisessentialfo
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